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我是 python 和 pytables 的新手。目前我正在写一个关于聚类和 KNN 算法的项目。这就是我所拥有的。

** * ** * ** ** 代码 * ** * ** * ** * ** * **** _

import numpy.random as npr
import numpy as np

step0：获取集群

dtype = np.dtype('f4')

pnts_inds = np.arange(100)
npr.shuffle(pnts_inds)
pnts_inds = pnts_inds[:10]
pnts_inds = np.sort(pnts_inds)
for i,ind in enumerate(pnts_inds):
    clusters[i] = pnts_obj[ind]

step1：将结果保存到名为 clst_fn.h5 的 HDF5 文件中

filters = tables.Filters(complevel = 1, complib = 'zlib')
clst_fobj = tables.openFile('clst_fn.h5', 'w')  
clst_obj = clst_fobj.createCArray(clst_fobj.root, 'clusters',
           tables.Atom.from_dtype(dtype), clusters.shape,
           filters = filters)
clst_obj[:] = clusters
clst_fobj.close()

step2：其他功能

废话

step3：从 clst_fn 加载集群

pnts_fobj= tables.openFile('clst_fn.h5','r')
for pnts in pnts_fobj.walkNodes('/', classname = 'Array'):
    break
#

step4：唤起另一个函数（称为knn）。函数输入参数是来自 pnts 的数据。我已经单独检查了 knn 功能。如果输入为 pnts = npr.rand(100,128)，此函数运行良好

def knn(pnts):
    pnts = numpy.ascontiguousarray(pnts)
    N = ctypes.c_uint(pnts.shape[0])
    D = ctypes.c_uint(pnts.shape[1])
#

使用 clst_fn 中的集群调用 knn（参见步骤 3）

knn(pnts)

** * ** * ** ** 代码 结束* ** * ** * ** * ** * ****

我现在的问题是python通过显示给我带来了困难：错误：IndexError：元组索引超出范围此错误来自“D = ctypes.c_uint（pnts.shape [1]）”这一行。

显然，输入参数一定有问题。有没有想过解决这个问题？先感谢您。

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