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我有这样的情况:

Gene       SAMPLE1   SAMPLE2 
 G1         0.33      0.21  
 G2         0.45      0.324 
 G3         0.765     0.654 
 G4         0.98      0.543 
 G5         0.565     0.13
 G6         0.123     0.943
 G7         0.321     0.572
....       ...       ......

数据不是真实数据。我需要:计算两侧 Pearson 相关检验的 p 值。

任何人都可以帮助我吗?我在R中很新。

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You can use cor.test to peform this correlation test. This is part of any standard R distribution. In your case with(dat, cor.test(Sample1, Sample2)) will perform the test you need.

Googling for R correlation test returned the documentation of cor.test as the first result.

于 2012-10-26T14:02:04.330 回答
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如上所述,您可以使用 cor.test() 函数:

 cor.test(data$SAMPLE1, data$SAMPLE2)

如果您是 R 的初学者,这里将详细描述两个变量之间的相关性检验:

http://www.sthda.com/english/wiki/correlation-test-between-two-variables

您也可以在线进行 pearson 相关性测试,无需任何安装:

http://www.sthda.com/english/rsthda/correlation.php

于 2014-10-31T02:51:57.753 回答