@backlin 的介绍
layout
使用或可以将多个简单图组合为单个图形中的面板par(mfrow=...)
。但是,更复杂的绘图往往会在内部设置自己的面板布局,从而使它们无法用作面板。有没有办法创建嵌套布局并将复杂的绘图封装到单个面板中?
我有一种感觉,该grid
包可以实现这一点,例如通过在单独的视口中绘制面板,但无法弄清楚如何。这是一个演示问题的玩具示例:
my.plot <- function(){
a <- matrix(rnorm(100), 10, 10)
plot.new()
par(mfrow=c(2,2))
plot(1:10, runif(10))
plot(hclust(dist(a)))
barplot(apply(a, 2, mean))
image(a)
}
layout(matrix(1:4, 2, 2))
for(i in 1:4) my.plot()
# How to avoid reseting the outer layout when calling `my.plot`?
@alittleboy 的原始问题
我使用包中的heatmap.2
函数gplots
来生成热图。以下是单个热图的示例代码:
library(gplots)
row.scaled.expr <- matrix(sample(1:10000),nrow=1000,ncol=10)
heatmap.2(row.scaled.expr, dendrogram ='row',
Colv=FALSE, col=greenred(800),
key=FALSE, keysize=1.0, symkey=FALSE, density.info='none',
trace='none', colsep=1:10,
sepcolor='white', sepwidth=0.05,
scale="none",cexRow=0.2,cexCol=2,
labCol = colnames(row.scaled.expr),
hclustfun=function(c){hclust(c, method='mcquitty')},
lmat=rbind( c(0, 3), c(2,1), c(0,4) ), lhei=c(0.25, 4, 0.25 ),
)
但是,由于我想在单个图中比较多个热图,所以我使用par(mfrow=c(2,2))
然后调用heatmap.2
四次,即
row.scaled.expr <- matrix(sample(1:10000),nrow=1000,ncol=10)
arr <- array(data=row.scaled.expr, dim=c(dim(row.scaled.expr),4))
par(mfrow=c(2,2))
for (i in 1:4)
heatmap.2(arr[ , ,i], dendrogram ='row',
Colv=FALSE, col=greenred(800),
key=FALSE, keysize=1.0, symkey=FALSE, density.info='none',
trace='none', colsep=1:10,
sepcolor='white', sepwidth=0.05,
scale="none",cexRow=0.2,cexCol=2,
labCol = colnames(arr[ , ,i]),
hclustfun=function(c){hclust(c, method='mcquitty')},
lmat=rbind( c(0, 3), c(2,1), c(0,4) ), lhei=c(0.25, 4, 0.25 ),
)
但是,结果不是单个图中的四个热图,而是四个单独的热图。换句话说,如果我使用pdf()
输出结果,文件是四页而不是一页。我需要在某处更改任何参数吗?非常感谢!