我在 R 中调用 FORTRAN 程序并分析 FORTRAN 的输出文件，该文件有点大（每次迭代大约 50M）。每次迭代大约需要 50 秒，其中read.table命令需要 42 秒。由于我需要重复这个程序 100,000 次，我想知道是否有更好的方法来加速它？
例如，是否可以让 FORTRAN 将所有内容保存到内存中并将其传递给 R？
谢谢！
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绝对 - 在 Fortran 中将文件写入二进制文件，然后通过readBin()R 读取它们，这将非常快。但是请确保您检查字节顺序，四字节对八字节浮点等等。
如果您想要一个经过测试的库，请查看各种序列化库，例如 RProtoBuf 等。虽然不确定有多少有 Fortran 绑定...
编辑：根据附加组件页面，Protocol Buffers 和 Fortran 运气不佳。也许像 hdf5 这样的科学格式对你来说会更好。
于 2012-10-24T21:57:23.380 回答