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我正在尝试编写一个程序,该程序采用大型数据框并用这些值的累积频率(按升序排序)替换每一列值。例如,如果值的列是:5、8、3、5、4、3、8、5、5、1。那么相对频率和累积频率是:

  • 1: rel_freq=0.1, cum_freq = 0.1
  • 3: rel_freq=0.2, cum_freq = 0.3
  • 4: rel_freq=0.1, cum_freq = 0.4
  • 5: rel_freq=0.4, cum_freq = 0.8
  • 8: rel_freq=0.2, cum_freq = 1.0

那么原来的列变成:0.8, 1.0, 0.3, 0.8, 0.4, 0.3, 1.0, 0.8, 0.8, 0.1

以下代码正确执行此操作,但可能由于嵌套循环,它的伸缩性很差。知道如何更有效地执行此任务吗?

mydata = read.table(.....)

totalcols = ncol(mydata)
totalrows = nrow(mydata)

for (i in 1:totalcols) {
    freqtable = data.frame(table(mydata[,i])/totalrows)  # create freq table
    freqtable$CumSum = cumsum(freqtable$Freq)   # calc cumulative freq

    hashtable = new.env(hash=TRUE)
    nrows = nrow(freqtable)

    # store cum freq in hash
    for (x in 1:nrows) {
        dummy = toString(freqtable$Var1[x])
        hashtable[[dummy]] = freqtable$CumSum[x]
    }

    # replace original data with cum freq
    for (j in 1:totalrows) {
        dummy = toString(mydata[j,i])
        mydata[j,i] = hashtable[[dummy]]
    }
}
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2 回答 2

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for这处理没有-loop的单列:

R> x <- c(5, 8, 3, 5, 4, 3, 8, 5, 5, 1)
R> y <- cumsum(table(x)/length(x))
R> y[as.character(x)]
  5   8   3   5   4   3   8   5   5   1 
0.8 1.0 0.3 0.8 0.4 0.3 1.0 0.8 0.8 0.1 
于 2012-10-23T19:02:07.907 回答
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这是一种方法。使用具有两个变量的数据框,每个变量都包含您的示例数据

d <- data.frame(var1 = c(5, 8, 3, 5, 4, 3, 8, 5, 5, 1),
                var2 = c(5, 8, 3, 5, 4, 3, 8, 5, 5, 1))

使用一个简单的函数

  1. 生成由cumsum()给出的相对比例的table(x) / length(x),然后
  2. match()具有累积和表名称的变量中的观察值,然后
  3. 使用 id 匹配从累积总和表中进行选择(并取消命名)

这样的功能是:

f <- function(x) {
    tab <- cumsum(table(x) / length(x))
    ind <- match(x, as.numeric(names(tab)))
    unname(tab[ind])
}

在实践中,我们使用lapply()并强制到一个数据框:

out <- data.frame(lapply(d, f))
out

这使:

R> out
   var1 var2
1   0.8  0.8
2   1.0  1.0
3   0.3  0.3
4   0.8  0.8
5   0.4  0.4
6   0.3  0.3
7   1.0  1.0
8   0.8  0.8
9   0.8  0.8
10  0.1  0.1
于 2012-10-23T19:03:04.970 回答