3

我有一个 df :

head(df)

  Year              Asset1       Asset2        Asset3 Asset4    Asset5 
1 1857              1729900        32570       288482 1251642      0                     0     67374            89832
2 1858              1870213        35255       312262 1354817      0                     0     71948            95931
3 1859              1937622        36418       322562 1399505      0                     0     76773           102364
4 1860              1969257       207557        83393 1484403      0                     0     83102           110802
5 1861              2107481       222969        89585 1594627      0                     0     85843           114457
6 1862              2306227       235498        94619 1684234      0                     0     80613           211263

ddply用来构造一个新的 df,其中 Asset 2:5 除以 Asset1:

dft<-ddply(df,.(Year),transform, 

              Asset2=Asset2/Asset1,
              Asset3=Asset3/Asset1,
              Asset4=Asset4/Asset1,
              Asset5=Asset5/Asset1)

但是,如果有很多专栏,那就很安静了……有什么建议吗?

最好的祝福!

4

4 回答 4

8

sweep是为了:

读入数据的(修改)版本:

m <- read.table(text = " Year              Asset1       Asset2        Asset3 Asset4    Asset5 
+  1857              1729900        32570       288482 1251642      0                     
+  1858              1870213        35255       312262 1354817      0                     
+  1859              1937622        36418       322562 1399505      0                     
+  1860              1969257       207557        83393 1484403      0                     
+  1861              2107481       222969        89585 1594627      0            
+  1862              2306227       235498        94619 1684234      0   ",header = TRUE,sep = "")
> m
  Year  Asset1 Asset2 Asset3  Asset4 Asset5
1 1857 1729900  32570 288482 1251642      0
2 1858 1870213  35255 312262 1354817      0
3 1859 1937622  36418 322562 1399505      0
4 1860 1969257 207557  83393 1484403      0
5 1861 2107481 222969  89585 1594627      0
6 1862 2306227 235498  94619 1684234      0


> m[,3:6] <- sweep(m[,3:6],1,m[,2],"/")
> m
  Year  Asset1     Asset2     Asset3    Asset4 Asset5
1 1857 1729900 0.01882768 0.16676224 0.7235343      0
2 1858 1870213 0.01885079 0.16696601 0.7244186      0
3 1859 1937622 0.01879520 0.16647313 0.7222797      0
4 1860 1969257 0.10539864 0.04234744 0.7537884      0
5 1861 2107481 0.10579882 0.04250809 0.7566507      0
6 1862 2306227 0.10211397 0.04102762 0.7302984      0
于 2012-10-16T15:15:51.753 回答
5

好的,我有 2 个lapply解决方案。我对上面的解决方案进行了基准测试,并且循环实际上比矢量化解决方案更快。为什么?

编辑:见 nograpes 答案。

lapply解决方案:

m[, 3:6] <- do.call(cbind, lapply(m[, 3:6], function(x) x/m[, 2]))
m

和 lapply2:

lapply(3:6, function(i) {
    m[, i] <<- m[, i]/m[, 2]
})

#   Year  Asset1     Asset2     Asset3    Asset4 Asset5
# 1 1857 1729900 0.01882768 0.16676224 0.7235343      0
# 2 1858 1870213 0.01885079 0.16696601 0.7244186      0
# 3 1859 1937622 0.01879520 0.16647313 0.7222797      0
# 4 1860 1969257 0.10539864 0.04234744 0.7537884      0
# 5 1861 2107481 0.10579882 0.04250809 0.7566507      0
# 6 1862 2306227 0.10211397 0.04102762 0.7302984      0

在具有 1000 次复制的 i7 Windows 机器上进行微基准测试:

设置:

LAPPLY <- function() {
    m[, 3:6] <- do.call(cbind, lapply(m[, 3:6], function(x) x/m[, 2]))
    m
}

LOOP <- function() {
    for(i in 3:ncol(m)) {
      m[ ,i] <- m[ , i]/m[ ,2]
    }
    m
}

SWEEP <- function(){
    m[,3:6] <- sweep(m[,3:6],1,m[,2],"/")
    m
}

LAPPLY2 <- function() {
    lapply(3:6, function(i) {
        m[, i] <<- m[, i]/m[, 2]
    })
        m
}

VECTORIZED <- function(){
    m[,3:6]<-m[,3:6] / m[,2]
    m
}

VECTORIZED2 <- function(){
    m[,3:6]<-unlist(m[,3:6])/m[,2]
    m
}

microbenchmark( 
    SWEEP(),
    LAPPLY(),
    LOOP(), 
    VECTORIZED(),
    VECTORIZED2(),
    LAPPLY2(),
    times=1000L)  

结果:

Unit: microseconds
           expr      min       lq    median        uq       max
1      LAPPLY() 7483.059 7577.758 7649.3655 7839.9290 41808.754
2     LAPPLY2()  563.061  602.713  618.3405  661.9585  7535.308
3        LOOP()  540.669  581.254  594.7820  626.5050 35505.929
4       SWEEP() 2544.735 2602.581 2645.9650 2735.5320  8335.814
5  VECTORIZED() 2409.452 2454.235 2494.5870 2585.5535 37313.134
6 VECTORIZED2() 8952.055 9063.081 9153.8150 9352.3085 45742.247

在此处输入图像描述

lapply编辑:虽然我通过将索引传递给并全局分配这是一个循环正在做的事情来加快速度(lapply我相信是循环的包装器):

注意:LAPPLY2 必须最后进行基准测试,因为它会对 m 进行全局更改(并且 m 必须在运行 LAPPLY2 后重置)。演示为什么全局分配可能是危险的。

我还重复了 OP 中的数据帧 100 次(nrow x 100),以更好地模拟解决方案。

编辑 37 部分 B: 这是我的结果,没有复制数据框以及我如何复制数据框:

# Unit: microseconds
#            expr     min       lq  median       uq       max
# 1      LAPPLY() 428.710 451.5680 468.362 485.6220  1497.452
# 2     LAPPLY2() 331.212 355.9365 368.532 386.7260  1361.235
# 3        LOOP() 326.547 355.0040 369.465 383.9260  1361.235
# 4       SWEEP() 828.497 868.1490 890.541 924.5950 31512.726
# 5  VECTORIZED() 764.587 809.8370 828.497 859.9855  3042.486
# 6 VECTORIZED2() 374.596 394.6560 408.884 424.0460  1399.954


dfdup <- function(dataframe, repeats=10){
    DF <- dataframe[rep(seq_len(nrow(dataframe)), repeats), ]
    rownames(DF) <-NULL
    DF
}

m <- dfdup(m, 100)

于 2012-10-16T15:36:54.193 回答
2

我认为这是一个不错的、可读的替代方案:

df[,3:6]<-df[,3:6] / df[,2]

如果你想让它更具可读性,你可以这样做

df[,paste0('Asset',2:5)]<-df[,paste0('Asset',2:5)] / df[,'Asset1']

我发现上述函数很慢,因为它被传递到Ops.data.frame(我认为),而且很慢。为了避免这种情况:

df[,3:6]<-unlist(df[,3:6])/df[,2]

lapply但它只能与其他循环和版本一样快。

于 2012-10-16T15:37:18.643 回答
1

这并不是真正ddply的目的,在这种情况下您不需要它。 ddply适合根据其中一列中的值将数据框拆分为行。通常,您用于拆分数据框的列(在本例中为Year)将具有多个具有相同值的行。

在这里,您只是将一列除以另一列。您可以按如下方式执行此操作:

df$Asset2 <- df$Asset2/df$Asset1 #more human-readable

或者

df[ ,3] <- df[ ,3]/df[ ,2] #numbered columns are useful in loops

我怀疑有一种矢量化的方式来做你想做的事,但除非速度是一个主要问题,否则循环这个计算非常简单:

#[hide under desk to avoid vectorization police]
for(i in 3:ncol(df) {
  df[ ,i] <- df[ , i]/df[ ,2]
}

IMO 您可能希望重命名列,或保留旧列并制作新列,以避免混淆列是否包含比率或原始值。如果要创建新列,只需使用df[ ,ncol(df)+1] <- df[ , i]/df[ ,2]

于 2012-10-16T15:02:55.090 回答