python - 使用 igraph 导入加权边缘列表

Question

我有以下 txt 文件，以 edgelist 格式表示网络。

前两列代表通常情况：哪个节点连接到其他哪些节点

第三列代表权重，代表每个节点联系对方的次数。

我已经搜索了igraph文档，但没有提到在导入 txt 等标准文件格式时如何包含权重参数。

该文件可以从这里访问，这是我一直在使用的代码：

read.graph("Irvine/OClinks_w.txt", format="edgelist")

此代码将第三列视为重量以外的其他内容。

有谁知道解决方案？

Answer 1

以下是否会引起过多的烦恼？

g <- read.table("Irvine/OClinks_w.txt")
g <- graph.data.frame(g)

如果确实如此，则可以直接从文件中使用

g<-read.graph("Irvine/OClinks_w.txt",format="ncol")
E(g)$weight

Answer 2

如果您使用 Python 和 igraph，则以下代码行用于导入权重和顶点名称：

g1w=Graph.Read_Ncol("g1_ncol_format_weighted.txt",names=True)

注意：你必须告诉 igraph 读取 names 属性names=True，否则只会导入顶点编号。

其中 g1_ncol_format_weighted.txt 看起来像：

A B 2
B C 3

为确保导入正常工作，请使用以下行：

print(g1w.get_edgelist())
print(g1w.es["weight"])
print(g1w.vs["name"])