r - plot.new() 中的错误：R 中的图形边距太大

Question

我是 R 新手，但我用较小的数据集制作了许多相关图。但是，当我尝试绘制一个大型数据集（2gb+）时，我可以很好地绘制图，但图例没有出现。有什么建议吗？或替代品？

library(gplots)
r.cor <- cor(r)
layout(matrix(c(1,1,1,1,1,1,1,1,2,2), 5, 2, byrow = TRUE))
par(oma=c(5,7,1,1))
cx <- rev(colorpanel(25,"yellow","black","blue"))
leg <- seq(min(r.cor,na.rm=T),max(r.cor,na.rm=T),length=10)
image(r.cor,main="Correlation plot Normal/Tumor data",axes=F,col=cx)
axis(1, at=seq(0,1,length=ncol(r.cor)), labels=dimnames(r.cor)[[2]], 
    cex.axis=0.9,las=2)
axis(2,at=seq(0,1,length=ncol(r.cor)), labels=dimnames(r.cor)[[2]],
     cex.axis=0.9,las=2)
image(as.matrix(leg),col=cx,axes=T)

错误plot.new()：数字边距太大

tmp <- round(leg,2)
axis(1,at=seq(0,1,length=length(leg)), labels=tmp,cex.axis=1)

score 162 · Accepted Answer

在 Rstudio 中可能会发生此错误，这仅仅是因为您的“绘图”窗格太小了。尝试缩放您的“文件、绘图、包、帮助、查看器”，看看是否有帮助！

score 92 · Accepted Answer

问题是您的调用创建的小图形区域 2layout()不够大，无法仅包含默认边距，更不用说绘图了。

更一般地说，如果设备上的绘图区域大小不足以实际进行任何绘图，则会出现此错误。对于 OP 的情况，问题是绘图设备太小，无法包含所有子图及其边距，并留下足够大的绘图区域来绘制。

如果 Plot 选项卡太小而无法留下足够的空间来包含边距、绘图区域等，RStudio 用户可能会遇到此错误。这是因为该窗格的物理尺寸是图形设备的尺寸。这些不是独立的问题；RStudio 中的绘图窗格只是另一个绘图设备，如png()、pdf()、windows()和X11()。

解决方案包括：

减小边距的大小；这可能会有所帮助，特别是如果您尝试像 OP 一样在同一设备上绘制多个图。
增加设备的物理尺寸，无论是在对设备的调用中（例如png()，pdf()等）还是通过调整包含设备的窗口/窗格的大小
减小绘图上文本的大小，因为这可以控制边距的大小等。

减小边距的大小

在导致问题的行之前尝试：

par(mar = rep(2, 4))

然后绘制第二张图像

image(as.matrix(leg),col=cx,axes=T)

您需要在par()我展示的通话中调整边距的大小才能做到这一点。

增加设备尺寸

您可能还需要增加要在其上绘图的实际设备的大小。

最后一个提示，par()在更改默认值之前保存它们，因此将现有par()调用更改为：

op <- par(oma=c(5,7,1,1))

然后在绘图结束时

par(op)

score 72 · Accepted Answer

如果您在 RStudio 中收到此消息，单击 Plots 选项卡中的“broomstick”图形“Clear All Plots”并再次尝试 plot() 可能会起作用。

score 27 · Accepted Answer

这有时会在 RStudio 中发生。为了解决它，您可以尝试绘制到外部窗口（仅限 Windows）：

windows() ## create window to plot your file
## ... your plotting code here ...
dev.off()

score 21 · Accepted Answer

我在 R Studio 中遇到了这个错误，并且通过单击并从右到左拖动其边缘使侧边栏变大来简单地修复。

图片在这里：https ://janac.medium.com/error-in-plot-new-figure-margins-too-large-in-r-214621b4b2af

score 10 · Accepted Answer

检查您的对象是列表还是向量。为此，请键入is.list(yourobject)。如果这是真的，请尝试重命名它x<-unlist(yourobject)。这将使其成为您可以绘制的向量。

score 5 · Accepted Answer

5

如果您使用 RStudio，只需缩放此区域。

于 2016-04-27T17:42:17.447 回答

score 4 · Accepted Answer

我今天发现了这个错误。最初，我试图将其输出到.jpeg宽度和高度较低的文件中。

jpeg("method1_test.jpg", width=900, height=900, res=40)

后来我将宽度和高度增加到：

jpeg("method1_test.jpg", width=1900, height=1900, res=40)

错误不存在。:)

你也可以玩分辨率，如果分辨率高，你需要更多的宽度和高度。

score 2 · Accepted Answer

当我尝试绘制高维数据时出现此错误。如果这就是你的情况，请尝试多维缩放： http: //www.statmethods.net/advstats/mds.html

score 2 · Accepted Answer

我为这个错误苦苦挣扎了好几个星期（使用 RStudio）。我尝试将绘图窗口移动得越来越小，但这并没有始终如一的帮助。当我将应用程序移动（拖动）到更大的显示器时，问题就消失了！我惊呆了……浪费了这么多时间……我知道我的代码是正确的……

score 1 · Accepted Answer

如果保证金很低，那么最好从新的绘图设备开始：

dev.new()
# plot()
# save your plot
dev.off()

除非您绘制无法容纳的大东西，否则您将永远不会出现边距错误。

score 0 · Accepted Answer

RStudio Plots 画布限制了绘图的宽度和高度。但是，如果您从Rmarkdown代码块进行绘图，则它可以不受画布字段限制，因为绘图区域是根据纸张大小设置的。

例如：

    ```{r}
#inside of code chunk in Rmarkdown
        grid <- par(mfrow=c(4, 5))
        plot(faithful, main="Faithful eruptions")
        plot(large.islands, main="Islands", ylab="Area")
        ...
        par(grid)
    ```

score 0 · Accepted Answer

我今天发现了同样的错误。我试过“清除所有绘图”按钮，但它给了我同样的错误。然后这个技巧对我有用， 尝试通过拖动来增加情节区域。它肯定会帮助你。

score 0 · Accepted Answer

0

我刚刚使用了 Clear all plots 然后再次给出 plot 命令，这很有帮助

于 2019-07-22T07:19:13.610 回答

r - plot.new() 中的错误：R 中的图形边距太大

14 回答 14

减小边距的大小

增加设备尺寸

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