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我正在尝试添加一个merge需要 S4 的空间方法（因为它在两个不同对象的类型上调度）。

我尝试使用早期的解决方案，如下所示：

#' Merge a SpatialPolygonsDataFrame with a data.frame
#' @param SPDF A SpatialPolygonsDataFrame
#' @param df A data.frame
#' @param \dots Parameters to pass to merge.data.frame
#' 
#' @export
#' @docType methods
#' @rdname merge-methods
setGeneric("merge", function(SPDF, df, ...){
  cat("generic dispatch\n")
  standardGeneric("merge")
})
#' @rdname merge-methods
#' @aliases merge,SpatialPolygonsDataFrame,data.frame-method
setMethod("merge",c("SpatialPolygonsDataFrame","data.frame"), function(SPDF,df,...) {
  cat("method dispatch\n")
})

哪个有效：

x <- 1
class(x) <- "SpatialPolygonsDataFrame"
y <- data.frame()
> merge(x,y)
generic dispatch
method dispatch

您将不得不相信我，如果 x 真的是 SPDF 而不是伪造的，那么它不会返回如果您实际运行该代码（或不运行该代码，而只是使用更宽松的通用下面不返回错误）。SPDF 很难创建。

问题是它似乎覆盖了 S3 调度：

> merge(y,y)
generic dispatch
Error in function (classes, fdef, mtable)  : 
  unable to find an inherited method for function "merge", for signature "data.frame", "data.frame"

我该如何避免呢？我已经尝试从中删除函数定义，setGeneric以便它可以简单地读取setGeneric("merge")，但这也不起作用。我是否需要以某种方式导入mergeS3 泛型base？

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1 回答 1

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发生错误发送是因为泛型的主体不是“标准的”（我认为原因是，因为你做了除了调用以外的事情standardGeneric("merge")，你知道你在做什么，所以没有自动默认；也许我是弥补这一点，这确实是一个错误）。解决方案是设置一个允许默认调度的标准泛型

setGeneric("merge")

或明确提供标准调度

setGeneric("merge", function(x, y, ...) standardGeneric("merge"))

或显式指定默认方法

setGeneric("merge", function(x, y, ...){
  cat("generic dispatch\n")
  standardGeneric("merge")
}, useAsDefault=base::merge)
于 2012-10-03T16:19:08.030 回答