假设您有一个包含以下数据类型的字典:
{'abc':'AGCTAC', 'def': 'AGGTAC', 'ghi':'AGGTAG'}
我希望能够运行一个显示每个位置的值的函数,例如
(('A','A','A'),('G','G','G'),('C','G','G'))
然后可以运行一个计数器,例如人们建议的带有收藏柜的计数器。
假设您有一个包含以下数据类型的字典:
{'abc':'AGCTAC', 'def': 'AGGTAC', 'ghi':'AGGTAG'}
我希望能够运行一个显示每个位置的值的函数,例如
(('A','A','A'),('G','G','G'),('C','G','G'))
然后可以运行一个计数器,例如人们建议的带有收藏柜的计数器。
>>> d = {'abc':'AGCTAC', 'def': 'AGGTAC', 'ghi':'AGGTAG'}
>>> zip(*d.values())
[('A', 'A', 'A'), ('G', 'G', 'G'), ('C', 'G', 'G'), ('T', 'T', 'T'), ('A', 'A', 'A'), ('C', 'G', 'C')]
请记住,dicts 是无序的,因此元组中的元素可能以不同的顺序出现。但是,所有元组的顺序都是相同的
在 Python3 中, zip 返回一个“zip 对象”,因此您需要将其包裹tuple()
起来
>>> tuple(zip(*d.values()))
(('A', 'A', 'A'), ('G', 'G', 'G'), ('C', 'G', 'G'), ('T', 'T', 'T'), ('A', 'A', 'A'), ('C', 'G', 'C'))
如果您不需要中间元组,只需传递给Counter
>>> from collections import Counter
>>> Counter(zip(*d.values()))
Counter({('A', 'A', 'A'): 2, ('C', 'G', 'G'): 1, ('G', 'G', 'G'): 1, ('T', 'T', 'T'): 1, ('C', 'G', 'C'): 1})