我有如下脚本:
setwd ("I:/prep/Coord/RData/test")
#load .csv files
a.files <- grep("^Whirr", dir(), value=TRUE) #pattern matching
b.files <- paste0("Files_", a.files)
for(i in length(a.files)){
a <- read.table(a.files[i], header=T, sep=",", row.names=1) #read files start with Whirr_
b <- read.table(b.files[i], header=T, sep=",", row.names=1) #read files start with Files_
a
b
cr <- as.matrix(a) %*% as.matrix(t(a)
cr
diag(cr)<-0
cr
#write to file
write.csv(cr, paste0("CR_", a.files[i], ".csv"))
}
基本上,我想做的是比较两个文件名末尾有相似文件名的文件,并进行计算,并将结果写入文件。
当我尝试打印 a.files 和 b.files 时,输出对我来说似乎没问题。输出如下:
> a.files <- grep("^Whirr", dir(), value=TRUE) #pattern matching
> b.files <- paste0("Files_", a.files, sep="")
Error: could not find function "paste0"
> a.files
[1] "Whirr_127.csv" "Whirr_128.csv"
> b.files
[1] "Files_ Whirr_127.csv" "Files_ Whirr_128.csv"
>
我尝试为脚本提供多个文件,但收到如下错误消息:
Error in file(file, "rt") : cannot open the connection
In addition: Warning message:
In file(file, "rt") : cannot open file 'Files_ Whirr_128.csv': No such file or directory
所以,我尝试使用 file.choose,但它对我也不起作用。
感谢专家的帮助