r - read.table 以意想不到的方式解析文本文件

Question

我正在尝试使用 R（64 位）读取一个大矩阵。该矩阵有 14.000 列和 900 行。问题在于，在矩阵的某个点，R 将一行拆分为新行。分裂不止一次。我想问题出在 R 内存中，即使我使用的是 64 位。谁能帮我？提前致谢。

仅 1 行示例：（来自 shell Unix）

SELT 0.00134 TGH 0.776554 P53 0.23436 MYC 0.2351 BRCA 0.7654.... # (the line has 9.573 columns)

在 Rread.delim()或read.table()（仅读取文件）之后：

SELT 0.00134 TGH 0.776554 P53 0.23436   
MYC 0.2351 BRCA 0.7654....

MYC 0.2351 BRCA 0.7654错误地在新行上。

埃莱奥诺拉

Answer 1

我有同样的问题。我的解决方案是在 .txt 文件中添加一个名称：“V1”、“V2”...“Vmax_number_of_columns”。有了这个，它起作用了。

Answer 2

我们验证了我们执行的并行分析的输出已损坏，因此这就是 R“未能”正确读取文件的原因。无论如何，非常感谢您的帮助！