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我使用 Intel 的 MKL 库构建了 Numpy(对我来说这是一个艰难的过程,我花了一整天的时间!)。Numpy 需要使用 LD_LIBRARY_PATH 环境变量链接到 MKL 库,或者至少这是我这样做的方式......所以我在 .bashrc 中使用 export 来保存路径,当我启动新控制台并运行 python 时, Numpy 已正确加载库。

问题是它不适用于我使用 Pydev 开发程序的 Eclipse。我仍然可以在 Eclipse 的首选项中的某处添加 LD_LIBRARY_PATH,但是当我尝试安装 Scipy 时问题变得真实。Scipy 的安装脚本需要导入 Numpy,即使正确设置了 LD_LIBRARY_PATH,我仍然遇到无法导入的 MKL 库的错误:

$ sudo python setup.py install
Traceback (most recent call last):
  File "setup.py", line 208, in <module>
    setup_package()
  File "setup.py", line 145, in setup_package
    from numpy.distutils.core import setup
  File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/numpy/__init__.py", line 137, in <module>
    import add_newdocs
  File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/numpy/add_newdocs.py", line 9, in <module>
    from numpy.lib import add_newdoc
  File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/__init__.py", line 4, in <module>
    from type_check import *
  File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/type_check.py", line 8, in <module>
    import numpy.core.numeric as _nx
  File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/__init__.py", line 5, in <module>
    import multiarray
ImportError: libimf.so: cannot open shared object file: No such file or directory

libimf.so 是我必须链接的 MKL 共享库之一。除了直接修改__init__.pyNumpy 的文件(我宁愿避免这样做,因为可能有更简洁的方法)之外,我不知道如何将 Numpy 永久链接到 MKL 库。

谢谢你的帮助!

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感谢 Talonmies 的评论,我找到了做到这一点的方法!必须编辑文件/etc/ld.so.conf并添加库的路径。以下是我如何找到需要添加的路径(这是非常经验的......):

每当我使用与无法导入的库相关的 Numpy 时遇到错误时,我都会以这种方式查找该库的路径:

find /opt/intel -name library.so

我得到例如路径: /opt/intel/path/to/library.so

我将此行添加到文件中/etc/ld.so.conf

include /etc/ld.so.conf.d/*.conf

# Manually added lines
/opt/intel/path/to/library.so

然后运行ldconfig以“链接”库!

干杯! 谢谢你Talonmies!

于 2012-09-04T17:11:06.960 回答