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我正在寻找一种方法来加快这样的文件加载:

数据包含大约 100 万行,制表符以“\t”(制表符)和 utf8 编码分隔,使用下面的代码解析完整文件大约需要 9 秒。但是,我希望几乎在一秒钟内!

def load(filename):
    features = []
    with codecs.open(filename, 'rb',  'utf-8') as f:
        previous = ""
        for n, s in enumerate(f):
            splitted = tuple(s.rstrip().split("\t"))
            if len(splitted) != 2:
                sys.exit("wrong format!")
            if previous >= splitted:
                sys.exit("unordered feature")
            previous = splitted
            features.append(splitted)
    return features   

我想知道是否有任何二进制格式的数据可以加快速度?或者,如果我可以从某些NumPy或任何其他库中受益,以加快加载速度。

也许您可以就另​​一个速度瓶颈给我建议?

编辑:所以我尝试了你的一些想法,谢谢!顺便说一句,我真的需要巨大列表中的元组(字符串,字符串)......这是结果,我获得了 50% 的时间 :) 现在我要处理 NumPy 二进制数据,正如我所注意到的另一个巨大的文件加载起来真的很快......

import codecs

def load0(filename): 
    with codecs.open(filename, 'rb',  'utf-8') as f: 
    return f.readlines() 

def load1(filename): 
    with codecs.open(filename, 'rb',  'utf-8') as f: 
    return [tuple(x.rstrip().split("\t")) for x in f.readlines()]

def load3(filename):
    features = []
    with codecs.open(filename, 'rb',  'utf-8') as f:
    for n, s in enumerate(f):
        splitted = tuple(s.rstrip().split("\t"))
        features.append(splitted)
    return features

def load4(filename): 
    with codecs.open(filename, 'rb',  'utf-8') as f: 
    for s in f: 
        yield tuple(s.rstrip().split("\t")) 

a = datetime.datetime.now()
r0 = load0(myfile)
b = datetime.datetime.now()
print "f.readlines(): %s" % (b-a)

a = datetime.datetime.now()
r1 = load1(myfile)
b = datetime.datetime.now()
print """[tuple(x.rstrip().split("\\t")) for x in f.readlines()]: %s""" % (b-a)

a = datetime.datetime.now()
r3 = load3(myfile)
b = datetime.datetime.now()
print """load3: %s""" % (b-a)
if r1 == r3: print "OK: speeded and similars!"

a = datetime.datetime.now()
r4 = [x for x in load4(myfile)] 
b = datetime.datetime.now()
print """load4: %s""" % (b-a)
if r4 == r3: print "OK: speeded and similars!"

结果 :

f.readlines(): 0:00:00.208000
[tuple(x.rstrip().split("\t")) for x in f.readlines()]: 0:00:02.310000
load3: 0:00:07.883000
OK: speeded and similars!
load4: 0:00:07.943000
OK: speeded and similars!

非常奇怪的是,我注意到我在连续两次运行中几乎可以有两倍的时间(但不是每次):

>>> ================================ RESTART ================================
>>> 
f.readlines(): 0:00:00.220000
[tuple(x.rstrip().split("\t")) for x in f.readlines()]: 0:00:02.479000
load3: 0:00:08.288000
OK: speeded and similars!
>>> ================================ RESTART ================================
>>> 
f.readlines(): 0:00:00.279000
[tuple(x.rstrip().split("\t")) for x in f.readlines()]: 0:00:04.983000
load3: 0:00:10.404000
OK: speeded and similars!

最新编辑:好吧,我尝试修改以使用numpy.load...这对我来说很奇怪...来自带有我的 1022860 字符串和 10 KB 的“普通”文件。做完之后,numpy.save(numpy.array(load1(myfile)))我去了 895 MB !然后重新加载它,numpy.load()我在连续运行中得到这种时间:

  >>> ================================ RESTART ================================
  loading: 0:00:11.422000 done.
  >>> ================================ RESTART ================================
  loading: 0:00:00.759000 done.

可能是 numpy 会做一些内存工作以避免将来重新加载吗?

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3 回答 3

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试试这个版本,因为你提到检查并不重要,我已经消除了它。

def load(filename):
    with codecs.open(filename, 'rb',  'utf-8') as f:
        for s in f:
            yield tuple(s.rstrip().split("\t"))

results = [x for x in load('somebigfile.txt')]
于 2012-09-03T16:15:33.350 回答
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检查实际读取文件行的​​秒数,例如

def load(filename):
    features = []
    with codecs.open(filename, 'rb',  'utf-8') as f:
        return f.readlines()

如果明显小于 9 秒,则

  1. 尝试其他使用多处理并拆分检查 CPU 内核之间的线路和/或
  2. 使用更快的解释器,如 pypy

看看这些是否能加快速度

于 2012-09-03T15:55:38.050 回答
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如建议的那样,检查了迭代文件需要多长时间后bpgergo,您可以检查以下内容:

  • 如果您知道您的文件包含 10^6 行,则可以预先分配列表。它应该比在每次迭代中附加它更快。只需用于features = [None] * (10 ** 6)初始化您的列表
  • 不要将结果split()投射到元组上,这似乎没有必要。
  • 你似乎根本没有从中受益enumerate。只需使用:for line in f:而不是for n, s in enumerate(f):
于 2012-09-03T15:59:08.273 回答