r - 如何将 pajek .paj 文件导入 igraph for R？

Question

本教程和包文档描述了如何处理 .net 格式的 pajek 文件，但我需要导入 .paj 文件。我不希望有可以导入所有 .paj 文件的代码，但也许有人的代码可以用于一些更简单的代码，然后我可以根据我的目的进行修改？

Answer 1

我将从以下方法开始：

1. 使用 读取整个文件readLines()。
2. 删除注释行，以 ' %' 开头的行。
3. 将线条切成片，以星号（' *'）开头的线条标志着新片的开始。
4. 按照出现的顺序检查每个部分，并将它们转换为适当的 R 数据结构。

在第 4 步中，您可能有几种类型的片段：

• *Network是网络的开始。
• *Vertices定义顶点并属于前一个网络。
• *Edges定义无向边，属于前一个网络。
• *Arcs定义有向边，属于前一个网络。
• *Partition是一个分区的开始。
• *Vector是向量的开始。

要将一个片段转换为 igraph 图，请将其与紧随其后的,和/或片段*Network粘合在一起，然后通过. 这样您就不需要创建临时文件。*Vertices*Edges*Arcsread.graph(..., format="pajek")textConnection()

和部分很简单*Partition，*Vector只需将它们转换为 R 向量，使用scan()and textConnection()。

我还没有尝试过这一切，但我认为这并不太难，应该可以正常工作。告诉我你是否有任何困难。

此外，Pajek 文件格式的文档记录很差，所以我可能错了，可能还有其他片段类型等。

您还可以考虑在igraph 错误跟踪器中添加错误报告以请求此功能。