sed - 在字符对之间插入空格 - sed

Question

另一个sed问题！我有成对的核苷酸数据

1 Affx-14150122 0 75891 00 CT TT CT TT CT 

按空格分隔，我需要在每一对中放置一个空格，例如

1 Affx-14150122 0 75891 0 0 C T T T C T T T C T 

我试过sed 's/[A-Z][A-Z]/ &/g'了sed 's/[A-Z][A-Z]/& /g'

并且两者都A-Z替换为..并且它永远不会像我想要的那样拆分这对（它在之前或之后放置空格或拆分每隔一对或类似的！）。

Answer 1

我认为这对你有用，但它并不完美！

echo "1 Affx-14150122 0 75891 00 CT TT CT TT CT" | \
  sed 's/\(\s[A-Z]\)\([A-Z]\)/\1 \2/g'

给

1 Affx-14150122 0 75891 00 C T T T C T T T C T

sed 's/\(\s[A-Z]\)\([A-Z]\)/\1 \2/g'匹配空格 ( \s) 大写字符 ( [A-Z])，将其放入组 ( \(...\))，然后匹配大写字符并将其存储在第二组中。然后这个匹配被第一组 ( \1) 空间第二组 ( \2) 替换。

注意：
当您有超过 2 个字符的序列时，这会失败。

Answer 2

一种awk仅修改字符对并且可能更健壮的解决方案，具体取决于您的输入数据：

echo "1 Affx-14150122 0 75891 00 CT TT CT TT CT" | \
  awk '
    {
      for(i=1;i<=NF;i++) {
        if($i ~ /^[A-Z][A-Z]$/){ 
          $i=substr($i,1,1)" "substr($i,2,1)
        }
       }
     }
     1'

给

1 Affx-14150122 0 75891 00 C T T T C T T T C T1

Answer 3

这可能对您有用（GNU sed）：

echo '1 Affx-14150122 0 75891 00 CT TT CT TT CT' | 
sed ':a;s/\(\s\S\)\(\S\(\s\|$\)\)/\1 \2/g;ta'
1 Affx-14150122 0 75891 0 0 C T T T C T T T C T

第二种方法有效，但可能会提供误报：

echo '1 Affx-14150122 0 75891 00 CT TT CT TT CT' | sed 's/\<\(.\)\(.\)\>/\1 \2/g'
1 Affx-14150122 0 75891 0 0 C T T T C T T T C T

Answer 4

这在 python 中实际上比在 awk 中更容易：

echo caca | python -c 'import sys;\
for line in sys.stdin: print (" ".join(line))'

卡卡