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我正在编写一些代码,这些代码对大量(数万到数十万个数值积分)问题进行了一些相当繁重的数值工作。幸运的是,这些集成是令人尴尬的并行,因此很容易使用 Pool.map() 将工作拆分到多个内核。

现在,我有一个具有以下基本工作流程的程序:

#!/usr/bin/env python
from multiprocessing import Pool
from scipy import *
from my_parser import parse_numpy_array
from my_project import heavy_computation

#X is a global multidimensional numpy array
X = parse_numpy_array("input.dat")
param_1 = 0.0168
param_2 = 1.505

def do_work(arg):
  return heavy_computation(X, param_1, param_2, arg)

if __name__=='__main__':
  pool = Pool()
  arglist = linspace(0.0,1.0,100)
  results = Pool.map(do_work,arglist)
  #save results in a .npy file for analysis
  save("Results", [X,results])

由于 X、param_1 和 param_2 是硬编码的,并且对于池中的每个进程都以完全相同的方式初始化,所以这一切都很好。现在我的代码已经工作了,我想让它让用户在运行时输入文件名、param_1 和 param_2,而不是硬编码。

需要注意的一点是,X、param_1 和 param_2 在工作完成时不会被修改。由于我不修改它们,我可以在程序开始时做这样的事情:

import sys
X = parse_numpy_array(sys.argv[1])
param_1 = float(sys.argv[2])
param_2 = float(sys.argv[3])

这样就可以解决问题,但是由于此代码的大多数用户都在 Windows 机器上运行代码,所以我宁愿不走命令行参数的路线。

我真正想做的是这样的:

X, param_1, param_2 = None, None, None

def init(x,p1, p2)
  X = x
  param_1 = p1
  param_2 = p2

if __name__=='__main__':
  filename = raw_input("Filename> ")
  param_1 = float(raw_input("Parameter 1: "))
  param_2 = float(raw_input("Parameter 2: "))
  X = parse_numpy_array(filename)
  pool = Pool(initializer = init, initargs = (X, param_1, param_2,))
  arglist = linspace(0.0,1.0,100)
  results = Pool.map(do_work,arglist)
  #save results in a .npy file for analysis
  save("Results", [X,results])

但是,当 pool.map 调用发生时,这当然会失败并且 X/param_1/param_2 都是 None 。我对多处理很陌生,所以我不确定为什么对初始化程序的调用失败。有没有办法做我想做的事?有没有更好的方法来解决这个问题?我也看过使用共享数据,但根据我对文档的理解,它只适用于不包括 numpy 数组的 ctypes。对此的任何帮助将不胜感激。

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2 回答 2

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我有一个类似的问题。如果您只想阅读我的解决方案,请跳过一些行:) 我必须:

  • 在运行在它的不同部分的线程之间共享一个 numpy.array 并且......
  • 向 Pool.map 传递一个具有多个参数的函数。

我注意到:

  • numpy.array 的数据被正确读取,但是......
  • numpy.array 上未永久更改的更改
  • Pool.map 在处理 lambda 函数时遇到问题,或者在我看来是这样(如果您不清楚这一点,请忽略它)

我的解决方案是:

  • 使目标函数仅作为参数列表
  • 使目标函数返回修改后的数据,而不是直接尝试在 numpy.array 上写入

我知道您的 do_work 函数已经返回了计算数据,因此您只需修改 to_work 以接受一个列表(包含 X、param_1、param_2 和 arg)作为参数,并在传递之前以这种格式将输入打包到目标函数它到 Pool.map。

这是一个示例实现:

def do_work2(args):
    X,param_1,param_2,arg = args
    return heavy_computation(X, param_1, param_2, arg)

现在您必须在调用 do_work 函数之前将输入打包。你的主要变成:

if __name__=='__main__':
   filename = raw_input("Filename> ")
   param_1 = float(raw_input("Parameter 1: "))
   param_2 = float(raw_input("Parameter 2: "))
   X = parse_numpy_array(filename)
   # now you pack the input arguments
   arglist = [[X,param1,param2,n] for n in linspace(0.0,1.0,100)]
   # consider that you're not making 100 copies of X here. You're just passing a reference to it
   results = Pool.map(do_work2,arglist)
   #save results in a .npy file for analysis
   save("Results", [X,results])
于 2012-09-23T06:28:29.067 回答
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为了使您的最后一个想法可行,我认为您可以在 if 语句中修改它们之前使用 global 关键字简单地制作Xparam_1和全局变量。param_2所以添加以下内容:

global X
global param_1
global param_2

直接在if __name__ == '__main__'.

于 2012-08-15T02:55:38.390 回答