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我正在使用 VMD（一个分子动力学可视化包），我想从 Perl 脚本打开 VMD，运行 Tcl 脚本，将输出打印到日志文件，然后关闭 VMD 并返回到 Perl 脚本。执行此操作的普通语法是：

system("vmd -dispdev text -eofexit < program.tcl > LOG");

据我所知，分解如下：

  • system("");：执行包含在引号中的 Bourne Shell 命令
  • vmd: 调用 VMD
  • -dispdev text: 以文本模式打开 VMD
  • -eofexit: 当达到 STDIN 上的 EOF 时终止 VMD
  • < prog.tcl：设置prog.tcl为标准输入；prog.tclvmd 将在完成 时终止
  • > LOG: 将 STOUT 写入文件<LOG>

现在这将完美地工作，除了我的 Tcl 脚本需要参数。我想做的是：

system("vmd -dispdev text -eofexit < program.tcl string1 string2 > LOG");

但是，在这种情况下，shell 会尝试将 string1 和 string2 作为文件读取。由于我对重定向的理解有限，我不确定第一行到底发生了什么，第二行到底出了什么问题，或者什么是好的解决方案。任何帮助，将不胜感激。

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3 回答 3

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抱歉，当 Tcl 脚本在另一个程序（如 vmd）中执行时，不要认为您可以直接将参数传递给您的 Tcl 脚本。我建议通过文件传递参数作为解决方法。例如。在 Perl 脚本中，在调用 vmd 之前，将参数写入 Tcl 语法的文件中：

open PARAMS, '>myparams.tcl';
print PARAMS "set arg1 $string1; set arg2 $string2";
close PARAMS;

然后在 program.tcl 的开头，而不是使用命令行参数 ($argv)，让它读取参数文件以获取参数值：

source myparams.tcl
于 2009-07-28T09:22:37.143 回答
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您正在做的是将 program.tcl 文件的内容发送到 vmd，而不是执行程序的输出。如果我理解你，你想用管道将 Tcl 程序连接到 vmd：

system("program.tcl arg1 arg2 | vmd -... > output.file");

编辑：

因此，如果 vmd 在标准输入上读取 Tcl 代码，您仍然可以在不使用临时文件的情况下传递参数：

system("( echo 'set arg1 str1; set arg2 str2'; cat program.tcl; ) | vmd ... > output_file");

或者

open my $fh, '<', 'program.tcl';
my @tcl = <$fh>;
close $fh;
unshift @tcl, "set arg1 str1\n", "set arg2 str2\n";
open $fh, '|-', 'vmd ... > output.file' or die 'msg...';
print $fh join('', @tcl);
close $fh or die 'msg...';
于 2009-07-28T14:02:00.267 回答
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您可以通过执行类似的操作将参数直接传递给 VMD

system(vmd -dispdev text -e program.tcl -args string1 string2 > LOG);

确保quit在program.tcl.

于 2010-12-13T21:15:13.617 回答