我有一个 .csv 文件,其中包含如下数据:
uc007ayl.1,ENSMUSG00000041439
uc009mkn.1,ENSMUSG00000031708
uc009mkn.1,ENSMUSG00000035491
我有一些代码可以逐列读取它们
import csv
import os.path
#open files + readlines
with open("C:/Users/Ivan Wong/Desktop/Placement/Lists of targets/Mouse/UCSC to Ensembl.csv", "r") as f:
reader = csv.reader(f, delimiter = ',')
#find files with the name in 1st row
for row in reader:
graph_filename = os.path.join("C:/Users/Ivan Wong/Desktop/Placement/Interesting reading/3'ORF",row[0]+"_nt_counts.txt.png")
if os.path.exists(graph_filename):
y = row[0]+'_nt_counts.txt'
r = open('C:/Users/Ivan Wong/Desktop/Placement/fp_mesc_nochx/'+y, 'r')
k = r.readlines()
r.close
del k[:1]
k = map(lambda s: s.strip(), k)
interger = map(int, k)
import iter
tools
#adding the numbers for every 3 rows
def grouper(n, iterable, fillvalue=None):
"grouper(3, 'ABCDEFG', 'x') --> ABC DEF Gxx"
args = [iter(iterable)] * n
return itertools.izip_longest(*args, fillvalue=fillvalue)
result = map(sum, grouper(3, interger, 0))
e = row[1]
现在我可以说
print row[1]
使其仅显示第二列。我需要这样做,因为我将在另一个文件中找到这些名称。但我有一个问题,因为我认为 python 正在以这种方式读取这些名称:
“E”、“N”、“S”、“M”、“U”、“S”等。
现在这会导致问题,因为我无法从另一个文件夹中找到匹配的名称。有谁知道问题出在哪里以及如何解决?