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我不了解 Ubunto 或 Perl,但仍需要在其上安装和运行程序。这就是我正在查看的内容:http: //vcftools.sourceforge.net/docs.html

在安装部分它说:

要构建 vcftools 可执行文件,请在 vcftools 文件夹中键入“make”。

Perl 脚本要求 VCF 文件由 bgzip 压缩并由 tabix 索引(这两个工具都是 tabix 包的一部分,可在此处下载)。这两个工具都必须位于 PATH 环境变量中列出的目录中。要运行 Perl 脚本,必须将 PERL5LIB 环境变量设置为包含 Vcf.pm 模块

导出 PERL5LIB=/path/to/your/installation/perl

所以好的,我提取并复制了他们的 VCFtools 文件夹到 ubuntu 的主文件夹中。然后我说“make”它给出了错误,然后我去下载了那个 tabidx 工具,但是从这一点上我不知道如何处理它,好吧我下载了 tabidx,但是接下来要做什么以及如何做呢?

谢谢。

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find / -name Vcf.pm

如果这给出了一个 - 并且只有一行 - 你可以这样做:

export PERL5LIB=$( dirname $( find . -name Vcf.pm ))
于 2012-07-31T17:59:04.963 回答