1

我有一个由字符串、列表和两个整数组成的复合对象字典。

我正在遍历这本字典，执行一些测试，然后根据这些测试将当前测试的对象保存到一个新字典中，然后修改一些属性。到目前为止，这一直是对新字典中的对象的引用，因此当我更改某些属性时，旧对象也会更改，我想避免这种行为。

我尝试使用复制模块中的copy.copyandcopy.deepcopy方法，但由于某种原因，复制后我无法更改属性。它们将保持原样。

我应该说我对 OOP 很陌生，所以将任何建议都瞄准白痴级别！

所以在下面的代码中，pathways是路径对象的字典，variants只是一个列表。 names()并且addMutant()是属于通路对象的方法。

如果它有帮助：通路对象包含属于该通路的基因列表（也是另一个对象）。我想找出变体列表（基因名称列表）中表示哪些途径，然后返回一个新的（较小的）途径字典，该字典将被修改以记录每个途径中突变基因的数量。该addMutant()方法只是增加一个属于通路对象的 int 属性。

def method(variants, pathways):
    vpathways = {}
            check = 0
            for var in variants:
                for k,v in pathways.iteritems():
                    if(var in v.names()):
                        check +=1
                        vpathways[k] = copy.deepcopy(v)
                        vpathways[k].addMutant()
     return(vpathways)

当我这样做的时候，vpathways 确实包含了正确的路径，但是每个路径的突变数量仍然是 0。我在 addMutant() 方法中添加了一个打印语句，它肯定被调用了，以及突变的数量属性增加，但不是在最终对象中。

编辑：途径类定义：

class Pathway():
    def __init__(self, pid = None, genes = [],nmut = 0 ):
        self.pid = pid
        self.genes = genes
        self.length = 0
        self.nmut = nmut
        for g in self.genes:
            self.length += g.seqlen
    def __str__(self):
        return('{0} pathway containing {1} genes, with a total sequence length of {2} and {3} mutations'.format(self.pid, len(self.genes), self.length, self.nmut))
    def __repr__(self):
        return self.__str__()   
    def addGene2Pathway(self,g):
        self.genes.append(g)
        self.length += g.seqlen
    def addMutant(self):
        self.nmut +=1  
    def names(self):
        l = []
        for g in self.genes:
            l.append(g.entrezid)
        return l
4

1 回答 1

1 
vpathways[k] = copy.deepcopy(v)

替换vpathways[k]之前包含的任何内容，因此最多.addMutant()可以工作。

于 2012-07-31T12:44:16.753 回答