出于演示的目的,我将稍微调整您的问题。我将使用与您类似的数据集,但连续使用 2 个 NA。这很容易概括为 5,不用担心。我还将使用更好地演示解决方案的数据集
所以首先,如何让你的数据看起来像我将要使用的:
library(reshape)
M2<-data.frame(colsplit(M$date, "-", c("ID", "year", "month", "day")),
value=M$value)
现在已经不在了,这是我要使用的数据:
library(reshape)
M2<-data.frame(colsplit(M$date, "-", c("ID", "year", "month", "day")),
value=M$value)
set.seed(1234)
M2<-expand.grid(ID=182, year=2002:2004, month=1:2, day=1:3, KEEP.OUT.ATTRS=FALSE)
M2 <- M2[with(M2, order(year, month, day, ID)),] #sort the data
M2$value <- sample(c(NA, rnorm(100)), nrow(M2),
prob=c(0.5, rep(0.5/100, 100)), replace=TRUE)
M2
ID year month day value
1 182 2002 1 1 -0.5012581
7 182 2002 1 2 1.1022975
13 182 2002 1 3 NA
4 182 2002 2 1 -0.1623095
10 182 2002 2 2 1.1022975
16 182 2002 2 3 -1.2519859
2 182 2003 1 1 NA
8 182 2003 1 2 NA
14 182 2003 1 3 NA
5 182 2003 2 1 0.9729168
11 182 2003 2 2 0.9594941
17 182 2003 2 3 NA
3 182 2004 1 1 NA
9 182 2004 1 2 -1.1088896
15 182 2004 1 3 0.9594941
6 182 2004 2 1 -0.4027320
12 182 2004 2 2 -0.0151383
18 182 2004 2 3 -1.0686427
首先,我们将删除一个月内连续出现 2 个或更多 NA 的所有情况:
NA_run <- function(x, maxlen){
runs <- rle(is.na(x$value))
if(any(runs$lengths[runs$values] >= maxlen)) NULL else x
}
library(plyr)
rem <- ddply(M2, .(ID, year, month), NA_run, 2)
rem
ID year month day value
1 182 2002 1 1 -0.5012581
2 182 2002 1 2 1.1022975
3 182 2002 1 3 NA
4 182 2002 2 1 -0.1623095
5 182 2002 2 2 1.1022975
6 182 2002 2 3 -1.2519859
7 182 2003 2 1 0.9729168
8 182 2003 2 2 0.9594941
9 182 2003 2 3 NA
10 182 2004 1 1 NA
11 182 2004 1 2 -1.1088896
12 182 2004 1 3 0.9594941
13 182 2004 2 1 -0.4027320
14 182 2004 2 2 -0.0151383
15 182 2004 2 3 -1.0686427
您可以看到连续两个 NA 已被删除。剩下的一个在那里,因为它属于两个不同的月份。现在我们将填写剩余的 NA。如果它们在一开始是正确的(我认为这是你想要的na.rm=FALSE
),那么争论就在那里。
library(zoo)
rem$value <- na.locf(rem$value, na.rm=FALSE)
rem
ID year month day value
1 182 2002 1 1 -0.5012581
2 182 2002 1 2 1.1022975
3 182 2002 1 3 1.1022975
4 182 2002 2 1 -0.1623095
5 182 2002 2 2 1.1022975
6 182 2002 2 3 -1.2519859
7 182 2003 2 1 0.9729168
8 182 2003 2 2 0.9594941
9 182 2003 2 3 0.9594941
10 182 2004 1 1 0.9594941
11 182 2004 1 2 -1.1088896
12 182 2004 1 3 0.9594941
13 182 2004 2 1 -0.4027320
14 182 2004 2 2 -0.0151383
15 182 2004 2 3 -1.0686427
现在,要使数据达到 5 或更多,您需要做的就是将maxlen
参数的值更改NA_run
为 5。
编辑:或者,如果您不希望从前几个月复制值:
library(zoo)
rem$value <- ddply(rem, .(ID, year, month), summarise,
value=na.locf(value, na.rm=FALSE))$value
rem
ID year month day value
1 182 2002 1 1 -0.5012581
2 182 2002 1 2 1.1022975
3 182 2002 1 3 1.1022975
4 182 2002 2 1 -0.1623095
5 182 2002 2 2 1.1022975
6 182 2002 2 3 -1.2519859
7 182 2003 2 1 0.9729168
8 182 2003 2 2 0.9594941
9 182 2003 2 3 0.9594941
10 182 2004 1 1 NA
11 182 2004 1 2 -1.1088896
12 182 2004 1 3 0.9594941
13 182 2004 2 1 -0.4027320
14 182 2004 2 2 -0.0151383
15 182 2004 2 3 -1.0686427