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在一年的时间里,我有timeseries来自三个不同传感器的数据,传感器大约每 3 分钟产生一个数据点,传感器不同步,因此它们在相对于彼此的不同时间产生一个数据点输出。

该数据位于一个包含大约 50 万条记录的表中的 sqlite 数据库中。我打算使用 javascript 图表库 dygraph 显示这些数据,我已经timeseries通过按传感器名称执行 sql 查询并保存到 csv 来分别为每个传感器生成图表。我希望有一个图表来显示所有数据点,一条线代表每个传感器。

我创建了一个名为'minutes_array'的numpy 2d类型字符串数组,第一列作为unix时间戳,四舍五入到最接近的分钟,覆盖从传感器时间序列开始到结束的每一分钟,三个空列填充每个数据可用的 3 个传感器中的一个。

分钟数组

[['1316275620' '' '' '']
 ['1316275680' '' '' '']
 ['1316275740' '' '' '']
 ..., 
 ['1343206920' '' '' '']
 ['1343206980' '' '' '']
 ['1343207040' '' '' '']]

然后传感器时间序列数据也被四舍五入到最接近的分钟,我使用 numpy.in1d 并从上面的“minutes_array”和“sensor_data”数组中获取时间戳,并为与该传感器相关的记录创建一个掩码。

传感器数据

[['1316275680' '215.2']
 ['1316275860' '227.0']
 ['1316276280' '212.2']
 ..., 
 ['1343206380' '187.7']
 ['1343206620' '189.4']
 ['1343206980' '192.9']]

 mask = np.in1d(minutes_array[:,0], sensor_data[:,0])

 [False  True False ..., False  True False]

然后,我希望修改 minutes_array 中对于该掩码为 true 的记录,并将 sensor_data 值放入 minutes_array 中时间戳之后的第一列。从我的尝试来看,当应用掩码时,似乎不可能改变原始的“minutes_array”,有没有办法在 numpy 中实现这个结果,而不使用 for 循环和单独匹配时间戳?

解决了

根据@eumiro 下面的回答,我使用了Pandas Docs 中的解决方案和上面描述的 'sensor_data' numpy 数组

sensors = ['s1','s2','s3']    
sensor_results = {}
for sensor in sensors:
    sensor_data = get_array(db_cursor, sensor)
    sensor_results[sensor] = pd.Series(sensor_data[:,1], \
                                   index=sensor_data[:,0])
df = pd.DataFrame(buoy_results)
df.to_csv("output.csv")
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半百万不是你用 python 字典无法管理的数字。

从数据库中读取所有传感器的数据,填充字典,然后构建一个 numpy 数组,或者更好的是,将其转换为pandas.DataFrame

import pandas as pd

inp1 = [(1316275620,   1), (1316275680,   2)]
inp2 = [(1316275620,  10), (1316275740,  20)]
inp3 = [(1316275680, 100), (1316275740, 200)]

inps = [('s1', inp1), ('s2', inp2), ('s3', inp3)]

data = {}
for name, inp in inps:
    d = data.setdefault(name, {})
    for timestamp, value in inp:
        d[timestamp] = value
df = pd.DataFrame.from_dict(data)

df就是现在:

            s1  s2   s3
1316275620   1  10  NaN
1316275680   2 NaN  100
1316275740 NaN  20  200
于 2012-07-27T10:47:55.103 回答