我有一个使用 Autoconf 和 Automake 的 C++ 项目。我认为我的目录中有太多源文件src，并将一些文件移动到子目录中。然后，我修改Makefile.am并将这些文件从 更改source.cpp为subdir/source.cpp。我知道这种方法应该有效，就像我之前为一些新文件所做的那样（但后来我没有重命名任何东西）。现在我像往常一样运行以下命令：
autoreconf
./configure
make clean
make
我收到类似这样的错误消息：
No rule to make target "source.cpp" needed for "source.o"
我不明白出了什么问题。我检查了我的 Makefile，但它似乎是正确的。所以我将我的 git 存储库克隆到了一个新的地方，并在那里尝试了一个 make，它工作了。没问题，我想，并git clean -xf在我的原始目录上做了一个。在此之后，编译仍然无法正常工作。现在我对两个目录结构进行了比较（又一个git clean -xf，发现还有一个.deps目录。删除后，它编译了。
故事的寓意如下：
make clean不删除依赖项。git clean -xf不会删除依赖项（可能是因为隐藏目录）。
有没有办法让make clean（或可能git clean）自动删除这个目录？当然我可以手动完成，但是清理后留下依赖文件非常烦人。