我正在尝试通过他们的 lsf 系统在服务器上运行脚本以提交作业。当我在不使用 bsub 的情况下运行 wget 时,wget 成功下载了我要获取的文件。但是,当我在 bsub 中运行相同的命令时,作业会运行,但是无论我允许作业运行多长时间,wget 都会卡住(下载文件只需要大约 10 秒)。以下是我运行的命令:
wget ftp://ftp-trace.ncbi.nih.gov/1000genomes/ftp/data/NA19238/sequence_read/ERR000018.filt.fastq.gz #This one runs no problems.
bsub -q short -J wgettest -oo wtest.out -eo wtest.err wget ftp://ftp-trace.ncbi.nih.gov/1000genomes/ftp/data/NA19238/sequence_read/ERR000018.filt.fastq.gz #This one does not work. :(
作业的stderr文件如下
--2012-07-05 20:57:59-- ftp://ftp-trace.ncbi.nih.gov/1000genomes/ftp/data/NA192 38/sequence_read/ERR000018.filt.fastq.gz => `ERR000018 .filt.fastq.gz' 正在解析 ftp-trace.ncbi.nih.gov... 130.14.250.10 正在连接到 ftp-trace.ncbi.nih.gov|130.14.250.10|:21... 已连接。以匿名身份登录... 登录不正确。
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