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如何用 sed 替换任何不是“A”、“C”、“G”、“T”、“N”的字符串？

例如我有以下数据：

>AFCCCCC 1
cagktgagtgataaggc
>AFCGH22 1
cagntgagtgstaaggc

我想删除不以'>'开头的不是[ACGTN]的每个字符

因此我希望得到这个输出：

 >AFCCCCC 1
 cagtgagtgataaggc
 >AFCGH22 1
 cagntgagtgtaaggc

请注意，我删除了第一个和第二个序列的“k”和“s”。

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1 回答 1

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试试这个：

sed '/^>/!s/[^ACGTN]//ig' input.txt
于 2012-07-06T00:07:00.383 回答