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我有一个距离的数据框 

df<-data.frame(site.x=c("A","A","A","B","B","C"),   
site.y=c("B","C","D","C","D","D"),Distance=c(67,57,64,60,67,60))

我需要将其转换为“dist”类的对象，但我不需要计算距离，因此我可以使用 dist() 函数。有什么建议吗？

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没有什么能阻止您自己创建 dist 对象。它只是一个距离向量，具有设置标签、大小等的属性。

使用你的df，这是如何

dij2 <- with(df, Distance)
nams <- with(df, unique(c(as.character(site.x), as.character(site.y))))
attributes(dij2) <- with(df, list(Size = length(nams),
                                  Labels = nams,
                                  Diag = FALSE,
                                  Upper = FALSE,
                                  method = "user"))
class(dij2) <- "dist"

或者您可以structure()直接通过以下方式执行此操作：

dij3 <- with(df, structure(Distance,
                           Size = length(nams),
                           Labels = nams,
                           Diag = FALSE,
                           Upper = FALSE,
                           method = "user",
                           class = "dist"))

这些给出：

> df
  site.x site.y Distance
1      A      B       67
2      A      C       57
3      A      D       64
4      B      C       60
5      B      D       67
6      C      D       60
> dij2
   A  B  C
B 67      
C 57 60   
D 64 67 60
> dij3
   A  B  C
B 67      
C 57 60   
D 64 67 60

注意：上面没有检查数据是否按正确的顺序。确保df按照示例中的正确顺序输入数据；即在你运行我展示的代码之前进行site.x排序。site.y

于 2012-07-05T12:29:06.747 回答
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不久前我遇到了类似的问题并像这样解决了它：

n <- max(table(df$site.x)) + 1  # +1,  so we have diagonal of 
res <- lapply(with(df, split(Distance, df$site.x)), function(x) c(rep(NA, n - length(x)), x))
res <- do.call("rbind", res)
res <- rbind(res, rep(NA, n))
res <- as.dist(t(res))
于 2012-07-05T12:07:12.800 回答
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?as.dist()应该对您有所帮助，尽管它需要一个矩阵作为输入。

于 2012-07-05T11:49:48.507 回答
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对于从谷歌进来的人...... reshape2 库中的 acast 函数对于这类东西来说更容易。

library(reshape2)
acast(df, site.x ~ site.y, value.var='Distance', fun.aggregate = sum, margins=FALSE)
于 2016-11-01T03:54:17.243 回答