我正在寻找一个好的数据库解决方案来存储大量(约 100 GB 到几 TB)的科学数据。理想情况下,它将能够处理大量数据。
要求
我的数据文件是“图像”,一个约 400 万个条目数组(1000x1000x3 整数 + 1000x1000 浮点数),加上每个图像约 50-100 个条目的相关元数据。元数据分层存储。图像将被组织到一个或多个“文件夹”(或“项目”)中,它们本身可以包含其他文件夹。一切都有所有者,等等。
我需要在一个或多个文件夹中搜索 100-10,000 张图像,主要基于其元数据。然后,我可能需要从图像中提取切片——如果我只需要其中的一小部分,我真的不想加载所有数据。图像应以压缩格式存储。
编辑:重要的是要强调我缺乏统一的数据。例如,图像是未知尺寸的浮点数或整数,通常具有 10^5-10^6 个条目,并且每个图像的元数据数量可能会有所不同。跨图像搜索元数据当然仅限于具有相同键的那些。
当前方法
我目前的,但不是很好的解决方案是混合数据库。首先,我使用 SQL 数据库(现在是 Django + MySQL)来处理“文件夹”、所有者,并且每个图像都有记录,但没有任何数据。我也可以为元数据创建记录。其次,我使用 PyTables 以 hdf5 格式存储图像和元数据,并将其视为数据库。这解决了切片和压缩问题,并允许我分层存储元数据,但 PyTables 似乎没有可扩展性,并且远不如商业数据库发达。(它不是为多用户环境而设计的:我正在编写自己的锁!这是一个不好的迹象。)
帮助!
我不是铁杆程序员,因此强烈推荐标准数据库解决方案。我的“优化”肯定会包括维护和编程成本。谁能推荐最喜欢的数据库解决方案或架构?关于关系vs分层vs其他的想法?
选项可能是 SciDB(不常见,可能很好)、SQL(听说这对这些应用程序不利,可能是 PostgreSQL?)和 HBase(实际上,我对此一无所知)。我觉得在科学,尤其是天文学,社区中肯定有好的解决方案,但是大型项目似乎需要一个认真的团队来建立和维护。
我很乐意提供更多信息。