r - 从 data.frame 创建邻接列表

Question

我有一个包含 2 列的 data.frame：节点 A，节点 B。框架中的每个条目都意味着节点 A 和 B 之间的图中的一条边。

必须有一个很好的单行来将此 data.frame 转换为邻接列表。有什么提示吗？

Answer 1

既然你标记了这个igraph，那么使用内置功能怎么样？

> g <- graph.data.frame( edges )
> adjlist <- get.adjedgelist(g)

唯一需要注意的是顶点的索引为零，这将随着 igraph 0.6 的变化而变化。

Answer 2

又快又脏...

> edges <- data.frame(nodea=c(1,2,4,2,1), nodeb=c(1,2,3,4,5))

> adjlist <- by(edges, edges$nodea, function(x) x$nodeb)

> for (i in as.character(unique(edges$nodea))) {
+   cat(i, ' -> ', adjlist[[i]], '\n')
+ }

1  ->  1 5
2  ->  2 4
4  ->  3

> adjlist
edges$nodea: 1
[1] 1 5
------------------------------------------------------------
edges$nodea: 2
[1] 2 4
------------------------------------------------------------
edges$nodea: 4
[1] 3

Answer 3

> edges <- data.frame(nodea=c(1,2,4,2,1), nodeb=c(1,2,3,4,5))

> attach(edges)

> tapply(nodeb,nodea,unique)

$`1`
[1] 1 5

$`2`
[1] 2 4

$`4`
[1] 3

Answer 4

您甚至如何表示 R 中的邻接表？它需要一组相邻节点的可变大小列表；那么你必须使用 list(); 但是在 R 中有什么好处呢？

我可以想到具有类似 sapply 功能的蹩脚技巧，但它们对每个节点进行线性扫描。但是玩了 1 分钟，这里是：pairlists 的列表，其中每对的第二项是邻接列表。输出比数据结构实际更疯狂。

> edgelist=data.frame(A=c(1,1,2,2,2),B=c(1,2,2,3,4))
> library(plyr)
> llply(1:max(edgelist), function(a) list(node=a, adjacents=as.list(edgelist$B[edgelist$A==a])))
[[1]]
[[1]]$node
[1] 1

[[1]]$adjacents
[[1]]$adjacents[[1]]
[1] 1

[[1]]$adjacents[[2]]
[1] 2



[[2]]
[[2]]$node
[1] 2

[[2]]$adjacents
[[2]]$adjacents[[1]]
[1] 2

[[2]]$adjacents[[2]]
[1] 3

[[2]]$adjacents[[3]]
[1] 4



[[3]]
[[3]]$node
[1] 3

[[3]]$adjacents
list()


[[4]]
[[4]]$node
[1] 4

[[4]]$adjacents
list()