我有兴趣将以下过程自动化,以进行我正在进行的系统文献综述。
我有大量的致病因子列表,我想对医学文献进行批量搜索,并返回我从每种类型的错误中获得的结果,然后将它们放入一个漂亮的 CSV 文件中,以便我可以将它们读入 R 和处理一些统计数据/频率分布等。
我可以使用 excel 表和 CTRL C + CTRL V 来完成这一切,但这需要一些时间。
基本上,我需要某种方式与托管我要搜索的数据库的OvidSP对话,然后输入格式正确的字符串以进行我想要执行的确切搜索。然后让 OvidSP 为我运行搜索,并返回它获得的点击次数。我想如果他们有可用的 API,这将很容易——我已经直接通过电子邮件向他们发送了这个问题。
我想知道是否有人认为这是可能的,或者为这项任务编写脚本的最佳方法是什么。我有一些 Java、C++ 的经验并开始学习 R - 我还想知道 Python 是否有用?
这是我希望实现的快速说明
我想搜索的错误(可以说是通过 CSV 文件输入程序)
* 沙门氏菌
* 大肠杆菌
* 流感
在此处插入精美的程序,该程序使用我的凭据连接到 Ovid 并运行以下搜索
1 - 沙门氏菌和发烧和医院 - 返回 9342 结果
2 - 大肠杆菌和发烧和医院 - 返回 93821 结果
3 - 流感和发烧和医院 - 返回 323 结果
程序将此数据写入格式良好的 CSV 文件中,我可以将其用于一些统计信息
我希望这是有道理的!提前致谢。