r - 计算列子集上的行均值

Question

给定一个示例数据框：

C1<-c(3,2,4,4,5)
C2<-c(3,7,3,4,5)
C3<-c(5,4,3,6,3)
DF<-data.frame(ID=c("A","B","C","D","E"),C1=C1,C2=C2,C3=C3)

DF
    ID C1 C2 C3
  1  A  3  3  5
  2  B  2  7  4
  3  C  4  3  3
  4  D  4  4  6
  5  E  5  5  3

创建包含ID列和每行平均值的第二个数据框的最佳方法是什么？像这样的东西：

ID  Mean
A    3.66
B    4.33
C    3.33
D    4.66
E    4.33

类似于：

RM<-rowMeans(DF[,2:4])

我想保持手段与他们ID的一致。

Answer 1

计算列子集上的行均值：

创建一个新的 data.frame，它将 DF 的第一列指定为名为 ID 的列，并计算该行上所有其他字段的平均值，并将其放入标题为“平均值”的列中：

data.frame(ID=DF[,1], Means=rowMeans(DF[,-1]))
  ID    Means
1  A 3.666667
2  B 4.333333
3  C 3.333333
4  D 4.666667
5  E 4.333333

Answer 2

从您的数据框开始DF，您可以使用该data.table包：

library(data.table)

## EDIT: As suggested by @MichaelChirico, setDT converts a
## data.frame to a data.table by reference and is preferred
## if you don't mind losing the data.frame
setDT(DF)

# EDIT: To get the column name 'Mean':

DF[, .(Mean = rowMeans(.SD)), by = ID]

#      ID     Mean
# [1,]  A 3.666667
# [2,]  B 4.333333
# [3,]  C 3.333333
# [4,]  D 4.666667
# [5,]  E 4.333333

Answer 3

$您可以在数据框中创建一个与均值对应的新行

DF$Mean <- rowMeans(DF[,2:4])

Answer 4

使用dplyr：

library(dplyr)

# exclude ID column then get mean
DF %>%
  transmute(ID,
            Mean = rowMeans(select(., -ID)))

或者

# select the columns to include in mean
DF %>%
  transmute(ID,
            Mean = rowMeans(select(., C1:C3)))

#   ID     Mean
# 1  A 3.666667
# 2  B 4.333333
# 3  C 3.333333
# 4  D 4.666667
# 5  E 4.333333

Answer 5

rowMeans很好，但是如果您仍在尝试围绕apply函数系列进行思考，那么这是开始理解它的好机会。

DF['Mean'] <- apply(DF[,2:4], 1, mean)

请注意，我正在做的作业与第一个示例略有不同。这种方法更容易将其合并到 for 循环中。

Answer 6

（另一个使用pivot_longer&pivot_wider来自最新Tidyr更新的解决方案）

您应该尝试使用 pivot_longer 将数据从宽格式变为长格式 阅读有关 pivot_longer 和 pivot_wider 的最新 tidyR 更新（https://tidyr.tidyverse.org/articles/pivot.html）

library(tidyverse)
C1<-c(3,2,4,4,5)
C2<-c(3,7,3,4,5)
C3<-c(5,4,3,6,3)
DF<-data.frame(ID=c("A","B","C","D","E"),C1=C1,C2=C2,C3=C3)

在这里输出

  ID     mean
  <fct> <dbl>
1 A      3.67
2 B      4.33
3 C      3.33
4 D      4.67
5 E      4.33