python - 如何：通过删除换行符从多行到单行

Question

我是python的新手，开始学习它。

我想制作一个脚本来计算文本文件中相同的字母模式。问题是我的文本文件有多行。当他们转到下一行时，我找不到我的一些模式。

我的文件和图案是 DNA 序列。

例子：

'attctcgatcagtctctctagtgtgtgagagactctagctagatcgtccactcactgac**ga 
tc**agtcagt**gatc**tctcctactacaaggtgacatgagtgtaaattagtgtgagtgagtgaa'

我正在寻找'gatc'。第二个被计算了，但第一个没有。

那么，如何将此文件制作为单行文本文件？

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dnatext = text.replace('\n', '')    // join text lines
gatc_count = dnatext.count('gatc')  // count 'gatc' occurrences

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当您从文件中读取模式时，您可以加入这些行：

    fd = open('dna.txt', 'r')
    dnatext = ''.join(fd.readlines())
    dnatext.count('gatc')

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这应该可以解决问题：

dnatext = "".join(dnatext.split("\n"))

于 2012-06-05T10:04:20.163 回答

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