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我正在尝试安装一个名为 qiime http://qiime.org/install/install.html的程序,并且我已经按照说明完成了先决条件的安装以及构建和安装,但我被卡住了,因为 python 找不到 defaultdict 计数器。我用谷歌搜索安装 defaultdict 但我什么也没找到。你如何安装defaultdict和counter?这是我得到的错误。谢谢

casey@casey-laptop:~/Downloads/Qiime-1.5.0/tests$ cd
casey@casey-laptop:~$ align_seqs.py -h
Traceback (most recent call last):
  File "/usr/local/bin/align_seqs.py", line 15, in <module>
    from qiime.util import parse_command_line_parameters, get_options_lookup
  File "/usr/local/lib/python2.6/dist-packages/qiime/util.py", line 25, in <module>
    from collections import defaultdict, Counter
ImportError: cannot import name Counter

casey@casey-laptop:~/Downloads/Qiime-1.5.0/tests$ python all_tests.py 
Traceback (most recent call last):
  File "all_tests.py", line 10, in <module>
    from qiime.util import (parse_command_line_parameters, get_options_lookup,
  File "/usr/local/lib/python2.6/dist-packages/qiime/util.py", line 25, in <module>
    from collections import defaultdict, Counter
ImportError: cannot import name Counter
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那个qiime程序似乎使用了模块的Counter类。collections但是,这是在 Python 2.7 中引入的,而您使用的是 Python 2.6。

因此,将您的 Python 更新到 2.7(或在 2.6 之外安装 2.7)是解决方案。

于 2012-06-02T09:06:46.273 回答
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类 collections.Counter

2.7 版中的新功能。

于 2012-06-02T09:14:08.823 回答