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我是 scipy 和 matplotlib 的新手,我一直在尝试将函数拟合到数据中。Scipy Cookbook中的第一个示例效果非常好,但是当我尝试使用从文件中读取的点时,我给出的初始系数(下面的 p0)似乎从未真正改变,并且协方差矩阵始终为 INF。

我试图在一条线上拟合数据,但无济于事。我导入数据的方式有问题吗?如果是这样,有没有更好的方法来做到这一点?

import matplotlib.pyplot as plt
from scipy.optimize import curve_fit
import scipy as sy

with open('data.dat') as f:
    noms = f.readline().split('\t')

    dtipus = [('x', sy.float32)] + [('y', sy.float32)]

    data = sy.loadtxt(f,delimiter='\t',dtype=dtipus)

    x = data['x']
    y = data['y']

    def func(x, a, b, c):
        return a*x**b + c

    p0 = sy.array([1,1,1])

    coeffs, matcov = curve_fit(func, x, y, p0)

    yaj = func(x, coeffs[0], coeffs[1], coeffs[2])

    print(coeffs)
    print(matcov)

    plt.plot(x,y,'x',x,yaj,'r-')
    plt.show()

谢谢!

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在我看来,问题确实在于您如何导入数据。伪造这个数据文件:

$:~/temp$ cat data.dat
1.0  2.0
2.0  4.2
3.0  8.4
4.0  16.1

并使用pylab'loadtxt函数进行读取:

import matplotlib.pyplot as plt
from scipy.optimize import curve_fit
import scipy as sy
import pylab as plb  

data = plb.loadtxt('data.dat')  
x = data[:,0]
y= data[:,1]

def func(x, a, b, c):
  return a*x**b + c

p0 = sy.array([1,1,1])
coeffs, matcov = curve_fit(func, x, y, p0)

yaj = func(x, coeffs[0], coeffs[1], coeffs[2])
print(coeffs)
print(matcov)

plt.plot(x,y,'x',x,yaj,'r-')
plt.show()

为我工作。顺便说一句,您可以使用dtypes来命名列。

于 2012-06-03T19:01:40.910 回答
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加载数据的根本问题是您将其转换为 float32,但在 scipy 0.10.1 中,curve_fit 适用于 float64 但不适用于 float32(这是一个错误,而不是一个功能)。您的示例适用于 float64。

于 2012-08-08T17:57:57.150 回答