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我试图运行需要 R 包“pkgDepTools”和“Rgraphviz”的代码。我收到错误消息，说这两个包都不适用于 R 版本 2.15.0。

谷歌搜索出现了以下网页 RPM Pbone，它似乎包含这些软件包：

http://rpm.pbone.net/index.php3/stat/4/idpl/17802118/dir/mandrake_other/com/R-pkgDepTools-1.20.0-1-mdv2012.0.i586.rpm.html

和

http://rpm.pbone.net/index.php3/stat/4/idpl/17802080/dir/mandrake_other/com/R-Rgraphviz-1.32.0-2-mdv2012.0.i586.rpm.html

但是，这些文件具有 *.rpm 扩展名，而不是我习惯的 *.tar.gz 或 *.zip 扩展名。

我使用的是 Windows 7 和 R 版本 2.15.0。我可以从 *.rpm 文件安装 R 包吗？

来自 Wikipedia *.rpm 似乎更适合 Linux：

http://en.wikipedia.org/wiki/RPM_Package_Manager

关于其他可能的解决方案，我在这里找到了几个较早的帖子，其中包含有关安装 R 包的类似问题，这些包不适用于最新版本的 R：

R中的双变量泊松回归？

包“GeneR”不可用

R 维恩图包尊敬的不可用 - 替代包？

我已经安装了最新版本的 Rtools 和包“devtools”。虽然我对他们一无所知。

这里有一个“Rgraphviz”的存档版本：

http://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/Rgraphviz/

但我找不到“pkgDepTools”的存档版本。

如果我可以使用上述 *.rpm 文件在 Windows 机器上安装软件包，有人可以提供说明吗？

如果我必须使用 Rtools 来构建它们，我可能会问更多问题，因为下面链接中的说明对我来说具有挑战性：

http://cran.r-project.org/doc/manuals/R-admin.html#Building-from-source

为了完全透明，如果可能的话，我希望有人可以为我建造它们。虽然我认识到自己从做这件事中获得的经验和知识从长远来看可能会有所回报。

谢谢你的任何建议。

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pkgDepTools和Rgraphviz是 BioConductor R 软件包，不是托管在 CRAN 上的。除非您将 R 配置为从这些存储库下载包，否则 R 将报告它们不可用；它只能从已配置安装的 repos 安装。

要安装这些 BioConductor 软件包，提供了一种精简的安装方法：

source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite(c("pkgDepTools", "Rgraphviz"))

BioConductor 网站的安装页面提供了更多详细信息

一般来说，你不能在 Windows 上使用 rpm 包；rpm 相当于 Linux 的二进制包。任何 C/C++/Fortran/etc 代码都将针对 Linux 而不是 Windows 进行编译。如果某个包确实不适用于您的 R 版本，请检查 CRAN 上是否说明了原因（通常 Windows 二进制文件需要几天的时间才能生成，或者可能存在对 CRAN Windows 构建机器上不可用的软件的要求） . 您可以尝试由 Uwe Ligges 运行的 WinBuilder 服务来为您构建包的 Windows 二进制文件，但如果包在 CRAN 上并且现在不表明它不再适用于当前的 R 并且无法构建。

一般来说，尝试更广泛地搜索包；在我的 Google 搜索结果中，搜索字符串“pkgDepTools”下的第一个命中是该软件包的 Bioconductor 页面，其中包括指向 Windows 二进制文件的链接以及有关如何从 R 中安装该软件包的说明。

于 2012-05-27T08:15:25.853 回答
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我认为这值得一个答案而不是评论。

Bioconductor 的一位绅士帮助我安装了 Rgraphviz。主要问题是我下载的 Rgraphviz 版本似乎只适用于 32 位版本的 R，而我运行的是 64 位版本的 R。我能够在 32 位版本的 R 中安装 Rgraphviz .

在我尝试安装 Rgraphviz 的一些过程中，我还在 PATH 语句中犯了一个或两个错误。但是，我第二条评论中的上述帖子提供了安装说明。

You just, it seems, cannot install the normal download version of Rgraphviz in the 64-bit version of R.

I think many of our emails back and forth are now posted on the Bioconductor forum.

I might edit this answer with more detailed instructions in the next 24-hours.

于 2012-05-28T21:24:58.357 回答