python - 如何分析python中的列？

Question

我有一个制表符分隔的表，它有多列（1500）和几行（10）。

基本上如何让我的程序查看列而不是行？我需要根据其中的内容来计算和组织列。

一个示例是计算非“-”列中有多少条目。

我认为 itertools.groupby 可能是我正在寻找的，但我不知道语法，或者它是否是正确的。

我已经学习编程/python 两个星期了，所以我不知道该怎么做。谢谢你能给我的任何帮助。

Answer 1

你可能想看看csvreader doc

拥有 csv 关键字，您会在 Google 上找到大量您想做的事情。

比如这个

Answer 2

如果您熟悉 R（即使您不熟悉），我推荐pandas库。它为 python 带来了 R 中的 DataFrame 结构，它允许您轻松地按行或列操作表（以及许多其他内容）。

Answer 3

filename = 'data.txt'
col = 2 # note, this uses a zero-based index.

with open(filename) as f:
    for line in f:
        target = line.split()[col]
        print target

col这会在文件中找到列filename并将找到的字符串放入变量target中。您可以相应地调整您的行动以达到目标。

假设每行将包含您要查找的列数，并且每行都包含数据。

Answer 4

如果文件不是太大（听起来好像不是），那么最简单的方法可能是将整个文件读入一个表格，然后从那里开始。例如：

text = open('some_file.txt').read()
table = [line.split('\t') for line in text.split('\n') if line.strip()]

然后，您使用例如将给定列提取为列表：

col5 = [row[5] for row in table]

您可以使用以下方法将表格从行列表转换为列列表：

columns = [[row[c] for row in table] for c in range(NUM_COLUMNS)

（这假设您有固定数量的列，并且所有行都具有完全相同的列数。）

Answer 5

您肯定想用上下文管理器 ( with) 打开一个文件。然后，您想遍历文件的行（即“行”）。你去掉一些空白字符，看看有没有剩下的东西。然后在出现特定分隔符的位置拆分行，从而为您提供此行中的“字段”：

with open(filename) as f:
    for line in f:
        line = line.strip()
        if line:
            tokens = line.split(delimiter)

这是一个强大的概念。只需将其与您的分析/评估代码合并即可。

Answer 6

谢谢你们每一个人的帮助！我尝试了它们中的每一个，它们都按照描述进行，并且可能会被合并到我的代码中（如果我更擅长 python）。我发现最适合我对列所做的工作是：

table = []
for each_line in homefile:
##doesn't include first line
        arr1 = each_line.strip("\n").split('\t')
        table.append(arr1)
##created a list of lists(matrix); each row as one entry in table(list)
cols = zip(*table)
##this switches rows and columns

然后，我能够对每一列进行处理，同时将每一列视为一个列表，其中包含来自原始制表符分隔表的每一列的条目。