python - 绘制一个 3D 强度数据的立方体

Question

我有 k 个(n,n,n)强度值的立方体，我想绘制它们。

我将它们视为扩散 MRI 中的扩散张量，我想将它们可视化（可能是椭圆体），然后尝试以某种方式“对齐”。目前我只是为每个立方体绘制它的 n 个“切片” (n,n)。

这个任务有没有python模块？

Answer 1

您可以为此使用 mayavi2。由于我没有你的数据的表示，我给出了一个最小的工作示例，在下面的网格上有一些随机球体：

import numpy
import mayavi.mlab as mlab

# Create some random data
N = 20
x, y, z = numpy.mgrid[-5:5:20j, -5:5:20j, -5:5:20j]
val = numpy.random.random(z.shape)

# Plot and show in mayavi2
pts = mlab.points3d(x, y, z, val, scale_factor=.5,transparent=True)
mlab.show()