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我正在使用 python,这是我的一段代码:

wp = open(outfile, 'w')
fields = line.split('\t')
gene_ID = fields[0]
chr = fields[1]
strand = fields[2]
start = int(fields[3])
end = int(fields[4])
bc = {'A': 'T', 'C': 'G', 'G': 'C', 'T': 'A', 'N':'N'}       
if strand == '+':
    wp.write(chr_string[start:end]) 
if strand == '-':
    newstart, newend = -(start + 1), -(end + 1)
    wp.write(bc[base.upper()] for base in chr_string[newstart:newend]) <--error pointed at this line

当我尝试运行我的整个代码时,我收到以下消息:

TypeError: must be str, not generator

有人知道我的代码有什么问题吗?

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1 回答 1

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bc[base.upper()] for base in chr_string[newstart:newend]是一个生成器表达式。join您需要通过 eg方法从中创建一个字符串:''.join(c[base.upper()] for base in chr_string[newstart:newend])

于 2012-04-27T17:39:02.537 回答