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我喜欢apsrtable(),并且发现扩展到其他类有点简单(特别是,我已经为mlogit对象进行了调整。但由于某种原因,该apsrtableSummary.sarlm()函数不像我编写的其他 hack 那样工作。

通常,我们需要重新定义系数矩阵,以便apsrtable()知道在哪里可以找到它。代码是

"apsrtableSummary.sarlm" <- function (x){
  s <- summary(x)
  s$coefficients <- s$Coef
  return(s)
}

我们还需要modelInfo为新类重新定义 ,如下所示:

setMethod("modelInfo", "summary.sarlm", function(x){
  env <- sys.parent()
  digits <- evalq(digits, envir=env)
  model.info <- list(
    "$\\rho$" = formatC(x$rho, format="f", digits=digits),
    "$p(\\rho)$" = formatC(x$LR1$p.value, format="f", digits=digits),
    "$N$" = length(x$fitted.values),
    "AIC" = formatC(AIC(x), format="f", digits=digits),
    "\\mathcal{L}" = formatC(x$LL, format="f", digits=digits)
  )
  class(model.info) <- "model.info"
  return(model.info)
})

然而,在定义这两个函数之后,调用apsrtable()不会打印系数(MWE 使用包中的示例lagsarlmspdep

library(spdep)
library(apsrtable)
data(oldcol)
COL.lag.eig <- lagsarlm(CRIME ~ INC + HOVAL, data=COL.OLD,
                         nb2listw(COL.nb, style="W"), method="eigen")
summary(COL.lag.eig)
# Load functions above
apsrtable(COL.lag.eig)

## OUTPUT ##
\begin{table}[!ht]
\caption{}
\label{} 
\begin{tabular}{ l D{.}{.}{2} } 
\hline 
  & \multicolumn{ 1 }{ c }{ Model 1 } \\ \hline
 %                           & Model 1 \\
 $\rho$.rho                 & 0.43   \\ 
$p(\rho)$.Likelihood ratio & 0.00   \\ 
$N$                         & 49     \\ 
AIC                         & 374.78 \\ 
\mathcal{L}                & -182.39 \\ \hline
 \multicolumn{2}{l}{\footnotesize{Standard errors in parentheses}}\\
\multicolumn{2}{l}{\footnotesize{$^*$ indicates significance at $p< 0.05 $}} 
\end{tabular} 
 \end{table}

如您所见,除了系数和标准误差不存在之外,一切都很好。很明显,摘要重新定义有效,因为

apsrtableSummary(COL.lag.eig)$coefficients
              Estimate Std. Error   z value     Pr(>|z|)
(Intercept) 45.0792505 7.17734654  6.280768 3.369041e-10
INC         -1.0316157 0.30514297 -3.380762 7.228517e-04
HOVAL       -0.2659263 0.08849862 -3.004863 2.657002e-03

几天来,我一直在拔头发,试图找到摆脱这种情况的方法。有小费吗?

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好吧,我想我可能是地球上唯一同时使用这两个软件包的人,但我想出了解决这个问题的方法。

事实证明,错误的根源在于类对象的coef方法。summary.sarlm通常,此方法返回一个带有系数表的矩阵,但对于此类,它只返回系数。下面的代码解决了这个问题。

setMethod("coef", "apsrtableSummary.sarlm", function(object) object$coefficients)

rho我还发现将术语作为模型系数包含在内很有用(方法在这方面并不一致)。

apsrtableSummary.sarlm <- function (x){
  s <- summary(x)
  s$rholine<- c(unname(s$rho), s$rho.se, unname(s$rho/s$rho.se),
                unname(2 * (1 - pnorm(abs(s$rho/s$rho.se)))))
  s$Coef <- rbind(s$rholine, s$Coef)
  rownames(s$Coef)[1] <- "$\\rho$"
  s$coefficients <- s$Coef
  return(s)
}
于 2012-09-28T02:22:12.523 回答