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我需要一个非常快速有效的算法来匹配 DNA 模式的字符串，最多允许 1 个不匹配。我尝试了 boyer-moore-horspool 算法，但它超过了所需的时间。文本和模式的长度最多为 100000。请建议我一个非常快速的算法，我可以开始努力解决这个问题。

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您可以尝试汉明距离算法，距离 = 1

http://en.wikipedia.org/wiki/Hamming_distance

于 2014-02-05T05:00:06.510 回答