r - 使用 cron 调度 R 脚本

Question

我正在尝试使用 cron 安排我的 R 脚本，但它不起作用。似乎 R 在 cron 中找不到包。任何人都可以帮助我吗？谢谢。

以下是我的 bash 脚本

# source  my profile
. /home/winie/.profile
# script.R will load packages
R CMD BATCH /home/script.R 

Answer 1

考虑这些提示

1. 使用 Rscript（或更小）而不是R CMD BATCH

2. 确保 cron 作业正在运行

3. 确保脚本自行运行

4. 在详细模式下测试几次

我的盒子通过调用 R 脚本的 cronjob 运行有点可见的CRANberries（我通过 littler 执行，但Rscript 应该也可以工作）。为此，/etc/crontab我的 Ubuntu 服务器上的条目是

# every few hours, run cranberries
16 */3 * * *    edd     cd /home/edd/cranberries && ./cranberries.r

所以每隔 16 分钟，每隔 3 个小时，就会使用我的 id 运行一个 shell 命令。它进入工作目录，并调用 R 脚本（具有可执行模式等）。

看着这个，我实际上可以运行脚本并setwd()在其中包含命令....