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如果我有这个 matlab 函数

function [result] = matlab_test(param1, param2)

disp(sprintf('param1 : %s', param1));
disp(sprintf('param2 : %s', param2));

result = 'hello matlab';

我想在 bash 脚本中调用这个 matlab 函数,比如

matlab -nodesktop -nosplash -nodisplay -r "try, A=matlab_test('test','matlab'); end; quit"
echo $A

我想要这个输出

test
matlab
hello matlab

我的要求是查找是否可以在我的 bash 脚本中使用来自 Matlab 的返回值,并将其传递给管道。我只想将我的应用程序分成小组件(文件)并通过管道/参数进行通信。简而言之,我想看看我可以在我的 bash 脚本中将 Matlab 脚本包装到多远,以便我可以设置我的代码架构。
如果我不能这样做,我将简单地将我需要从 matlab 返回值的部分捆绑到 matlab 脚本中。

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3 回答 3

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你问了两个问题。我会回答这两个问题,包括为什么第二个可能取决于您的操作系统(在我的操作系统上绝对不可能),然后提供有关问题相关解决方法的建议。

首先,当让 Matlab 与 shell 交互时,我使用这样的脚本。

#!/bin/sh 

cat <<EOF | matlab -nodesktop -nosplash -nodisplay 
A=matlab_test('$1','$2');
system(['export temp1=' A]); %doesn't work
setenv('temp2',A); %also doesn't work, I'll explain why below
exit
EOF
echo $temp1
echo $temp2

给出输出:

[XXXXXX@compute-0-138 ~]$ ./stack_ex test matlab
Warning: No window system found.  Java option 'MWT' ignored

                            < M A T L A B (R) >
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                               March 18, 2011


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>> param1 : test
param2 : matlab
>> >> >> 

很明显,设置环境变量的两个版本都不起作用。这就引出了你的第二个问题。

“回显”失败的原因是两者都system创建setenv了在 Matlab 关闭时关闭的外壳。也就是说,Matlab 不能在调用它的 shell 之外设置环境变量。

对于这篇文章中讨论的 Windows 系统,有一个解决方法,它使用 Microsoft 的工具。这里也提到

我不相信 *nix 系统可以从 Matlab 中设置环境变量。

这是一种与您描述的类似的方法。

我假设使用 echo 不是您真正想要做的。相反,我猜您想使用存储在环境变量中的字符串输出,以便进一步处理 shell 中的命令或脚本。一种可能的解决方法如下:

#!/bin/sh 

cat <<EOF | matlab -nodesktop -nosplash -nodisplay 
A=matlab_test('$1','$2');
setenv('temp1',A); %doesn't work
[a b] = system(['echo ' '$' 'temp1'])
exit
EOF

给出输出:[XXXXXX@compute-0-138 ~]$ ./stack_ex_3 test matlab 警告:未找到窗口系统。Java 选项“MWT”被忽略

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>> param1 : test
param2 : matlab
>> >> 
a =

     0


b =

hello matlab

这表明该命令echo $temp1在由创建的子 shell 中进行了评估,setenv并且 temp1 保存了分配给它的值。这个对 shell 的调用的结果现在存储在 b 中(a 保持 0 表示成功)。可以想象,您可以通过 system 命令传递您想要在 shell 中执行的全部操作,以便它在子 shell 中运行。不过,我们必须了解您的问题的更多细节才能对这种方法进行全面评估。

编辑和跟进 **********************

我能想到的最接近包装 Matlab 和 bash 的方法是以下技巧。您可以将 Matlab 脚本的输出通过以下管道传输到myresult.out

#!/bin/sh 

cat <<EOF | matlab -nodesktop -nosplash -nodisplay /> myresult.out 
A=matlab_test('$1','$2');
disp(['grepMe ' A])
exit
EOF

您可以从 grepgrepMemyresult.out,管道到 sed,并仅选择您需要的输出行的一部分,然后在脚本的其余部分上管道。这与我认为您可以实现的目标一样接近。

于 2012-04-10T23:13:26.430 回答
3

这几天一直在思考这个问题,突然想到了一些东西。您可以将其中一个 MATLAB 克隆用作 #! 脚本解释器。我的选择是 Octave,如下所示:

#! /usr/bin/octave -qf
A=matlab_test('test','matlab');
printf(A)

printf 将 A 的值放入 STDOUT 中,您可以从那里进行管道传输。

matteson@mauler[~]$ ./oshelltest
param1 : test
param2 : matlab
hello matlab
matteson@mauler[~]$ ./oshelltest | grep hello
hello matlab

现在 Octave 与 MATLAB 并不完全相同,但它很接近,也许足以满足您的需求。它还具有免费的优势。

于 2012-04-16T00:57:46.483 回答
2

您在这里尝试做两件事。首先:在 shell 中显示 Matlab 程序的输出。其次,在shell中分配一个变量。

当我尝试这个时,我发现 Matlab 会在 stdout 上写满它的开头消息,所以我最终做了:

mkfifo ~/matlab_output
matlab ... > /dev/null & cat ~/matlab_output

然后在matlab中,替换sprintf为:

f = fopen('~/matlab_output', 'w');
fprintf(f, 'param1 : %s', param1);
fclose(f);

这是您第一个要求的一个解决方案(您可以只写入一个普通文件,然后再对文件进行 cat 处理,但您必须为此使用&&,所以在 Matlab 完全完成之前您不会看到输出。)。您遇到的第二个问题 - 在 matlab 中执行“A = result”并能够在 shell 中“回显 $A” - 更难。您可以执行以下操作:

mkfifo ~/matlab_commands
mkfifo ~/matlab_output
matlab ... > /dev/null & cat ~/matlab_output & eval $(cat ~/matlab_commands)

在matlab中:

f2 = fopen('~/matlab_commands', 'w');
fprintf(f2, 'A=%s', double2str(results));
fclose(f2);

但我真的不知道这会有多好。

于 2012-04-10T08:45:27.750 回答