r - Kohonen 包：样本错误（1：nd，ng，replace = FALSE）

Question

我正在尝试对我的表达数据（约 500 个基因）运行 23 个样本的监督自组织图。将 23 个样本分为 4 组。我想获得这 4 组中具有相似表达模式的基因图谱。

在使用包的xyf功能Kohonen进行监督建模时，

data.xyf<-xyf(data,Y=annotation)

我遇到以下错误：

样本错误（1：nd，ng，replace = FALSE）：当“replace = FALSE”时，不能抽取大于总体的样本

我找不到在replace=T函数中调用的位置。软件包手册中没有关于此主题的信息。

Answer 1

您显然拥有比观察更多的单元格：您可以减少网格的尺寸（默认为 8*6），如文档中的示例所示?xyf。

xyf(data, Y=annotation, grid=somgrid(3,2))