问题标签 [r-dbi]

我在 R 中使用我与 RMySQL（和 DBI）连接的 MySQL 数据库。

我有一个函数可以在用户需要时动态读取 SQL 表（并将它们作为 R 对象导入）。他可以经常读表还是很长时间不向数据库发送查询，我不知道。

唯一允许的 SQL 操作是读取表（SELECT *，无条件）。

实际上，每次我需要读取一个新表然后关闭连接时，我都会打开一个新连接。但我正在寻找一些建议和最佳实践。

我精确地创建了一个连接函数作为“单例”，以避免并行打开到同一个数据库的两个连接。

重复向数据库发送连接请求是不是很糟糕？（即使之前的连接已关闭）我可以让 SQL 连接长时间打开，即使没有交互？

我用 R 的闪亮包创建了一个在线实验。假设我有 3 个反应值，称为"toss"、"decision" 和 " rating"。
此外，我在 Amazon Web 服务 RDS 上启动了一个MySQL数据库。版本是MySQL 5.6.22。
我成功地将非反应值（如时间戳）发送到 MySQL 数据库。所以我认为问题是在 Server.R 代码中找到与 MySQL 对话的代码的位置。对于非反应性值，当代码在反应性服务器功能之外（之前）时，它可以完美地工作。但是对于反应值，我想它应该在某个地方。

我试过这段代码：

这样，我不会收到错误消息。所以也许错误在insert into-code中。

此外，我不确定我使用的软件包是否适合此目的。我尝试了很多东西。每当我通过将反应值排除在 SQL 引用之外来添加反应值时，它就会停止工作。我开始认为 RMySQL 缺少该功能。手册中没有任何内容insert into。

有没有人能发现我犯的错误？

使用MonetDB.R，我想运行这个命令，但我不想打开 mclient。有没有通用的方法来做到这一点？

我的 redshift 服务器的建议 url?tcpKeepAlive=true附加了一个，所以它看起来像

现在，该RPostgres::dbConnect函数具有签名

那个男人dbConnect说

...- 描述附加连接选项的其他名称-值对，如http://www.postgresql.org/docs/9.4/static/libpq-connect.html#LIBPQ-PARAMKEYWORDS中所述

但是，我能看到的最接近我正在寻找的连接选项是

• keepalives：

  控制是否使用客户端 TCP keepalive。默认值为 1，表示开启，但如果不需要保活，您可以将其更改为 0，表示关闭。对于通过 Unix 域套接字建立的连接，此参数将被忽略。

• keepalives_idle：

  控制 TCP 应向服务器发送 keepalive 消息的不活动秒数。零值使用系统默认值。对于通过 Unix 域套接字建立的连接，或者如果禁用了 keepalives，则忽略此参数。它仅在 TCP_KEEPIDLE 或 TCP_KEEPALIVE 套接字选项可用的系统和 Windows 上受支持；在其他系统上，它没有影响。

• keepalives_interval：

  控制应该重新传输未被服务器确认的 TCP keepalive 消息的秒数。零值使用系统默认值。对于通过 Unix 域套接字建立的连接，或者如果禁用了 keepalives，则忽略此参数。它仅在 TCP_KEEPINTVL 套接字选项可用的系统和 Windows 上受支持；在其他系统上，它没有影响。keepalives_count

而且我不确定如何使用这些来模仿?tcpKeepAlive=true...的效果

我想我可以做类似的事情

但我想知道我需要为 、 和 选择x什么y值z？

感谢 MonetDB.R 库，我将 MonetDB 与 R 一起使用。

我似乎无法使用dbListConnections

我得到：

我应该假设dbListConnections在 MonetDB.R 中没有实现吗？

我的挑战是尝试使用 R 和 Shiny Server Pro 实现多连接应用程序：了解在给定时间和哪个用户建立了哪些连接会很有用。

是否有其他方法可以确定连接的用户？

顺便说一句，我也尝试使用查询：

但两者都返回NULL ...

我有一个包含各种令牌和频率计数的数据库。当我尝试使用 RSQLite 从 R 中检索这些时，我得到的负数较低，因此可能存在缓冲区溢出问题。如果我在说 sqliteman 中打开数据库并手动查询它，则数据会正确返回，所以它必须与 DBI 或 RSQLite 有关。

有没有办法通过 RSQLite 检索非常大的整数/浮点值而没有这个问题？

这是一个最小的例子：

我得到的输出如下：

我在 32 位 Windows 7 上使用 RStudio 0.98.501（R 版本 3.0.2），如果这完全相关的话。

编辑：请注意，SQLite 3 对内存和请求处理中的所有值使用 64 位整数。如以下评论中建议的那样，使用 BIGINT 代替 INT 会产生相同的溢出问题。

我遇到了这个奇怪的数据库连接问题RSQLite，我需要以某种方式解决。我已经在下面的链接中记录了如何重现此问题：

https://github.com/rstats-db/RSQLite/issues/101

这是数据库连接

我曾尝试关注SQLite用户遇到unable to open database file错误的其他基于 stackoverflow 的问题，但他们都说您必须明确设置完整的文件路径 - 这也没有帮助。

如果有人可以帮助诊断我遇到此错误的原因以便我可以解决它，我将不胜感激。

我最近问了一个类似的问题，更适合 dplyr。

请参阅dplyr 和 monetdb - 查询 schema.table 的适当语法？

由于 dplyr 和 MonetDB（根据上面的@Hannes Mühleisen 回复）没有适当的方法来管理模式，我决定使用 MonetDB.R / DBI 本机函数。

同样在这种情况下，结果也存在一些问题：目前，MonetDB.R 似乎只能正确管理每个数据库的一个模式。

让我们看一些代码。我创建了两个模式，并在每个模式中创建了相同的表名（标准 sql 实践）。然后我尝试将数据写入每个。

在这个阶段，我应该有两个名称相同但具有两个不同模式的表。dbListTables 证实了这一点（很高兴看到模式，但我可以没有它）：

但是，一旦我尝试使用与以前使用的查询相同的查询写入 mytable，灾难！

此时数据库处于混乱状态并要求回滚事务。

让我们尝试使用 overwrite=FALSE，看看是否有什么不同：

我击中了母矿脉append=true

后一个序列似乎可以正常工作并将数据加载到 bar 模式中而没有问题。但是你是否使用（像我通常那样）csvdump=TRUE你会得到另一个错误：

我总是可以避免使用csvdump，但我需要写大表......

我也尝试过copy_to& dplyr，但我也遇到了错误。

毫不奇怪，看到csvdump我也遇到了类似错误的问题monetdb.read.csv：如果在另一个模式中存在同名表时尝试加载 csv，则会出现错误。

难道我做错了什么？有没有更好的方法来做事？这是一个错误吗？

欢迎任何帮助。

我在 R 中有一个数据框，其中包含先前查询的输出。不幸的是，我不能直接在 SQL 中执行此操作，因为它太慢了，所以我使用 data.table 包。data.table 包的输出是一个包含 50,000 个 ID 的数据框。我需要从数据库中提取每个 id 的所有记录。

通常，我会做类似的事情，

但这行不通。另一种方法是在 for 循环中执行 50,000 个查询，但我认为必须有更有效的方法来执行此操作。

最有效的方法是什么？

我正在尝试HiveServer2使用dplyr.spark.hive包连接，但我发生了一个错误，我无法将用户名传递给dbConnect函数，这可能是我收到关于NULL client_protocol.

有谁知道如何解决这个问题或如何传递user/username给dbConnect驱动程序所在的函数JDBC？

这个beeline请求对我来说很好

但是这个 R等价物没有：

编辑 1

我尝试使用不同.jar的连接方式（如评论中所建议的那样），看起来之前的问题已经解决了（我可能用错了.jar），但现在我收到一条错误消息，告诉我连接未配置：