问题标签 [neuroscience]

For questions regarding programming in ECMAScript (JavaScript/JS) and its various dialects/implementations (excluding ActionScript). Note JavaScript is NOT the same as Java! Please include all relevant tags on your question; e.g., [node.js], [jquery], [json], [reactjs], [angular], [ember.js], [vue.js], [typescript], [svelte], etc.

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python - OverFlowError:数学范围错误 javaScript 到 python

我正在尝试建立一个动作电位模拟(电压相对于时间的图表,其中电压值是通过数值求解几个微分方程获得的)。我已经在 javaScript 中使用了这个在线模拟的代码,并试图将它翻译成 python。但是,由于 python 和 java 处理浮点数的方式不同,我得到一个溢出错误:数学范围错误。有谁知道在这种特定情况下我可以如何规避这种情况?我发布了我写的所有内容和我的错误输出:

错误:

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matlab - 使用核平滑将曲线拟合到条形图 - MATLAB

我经历了许多主题和建议,但我仍然无法在条形图上充分覆盖平滑线。

这是我的情节:条形图。它表示神经元随时间的放电率。在这种情况下, 0是一个感兴趣的事件,我在6000ms之前(因此为负数)和5500ms之后绘制数据。

我需要的是用内核平滑来平滑这些数据(条形图),并将其表示为一条覆盖有条形图的线。

关于如何正确执行此操作的任何输入?

先感谢您。干杯!

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neuroscience - 有人知道具有多电极(几个通道)记录的多个神经元数据的来源(我更喜欢真实数据而不是人工数据)吗?

我的意思是用多电极记录的多个神经元的数据。我需要这些数据作为我实验的输入。

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matlab - 随时间测量不同神经元的尖峰相关性

我正在尝试寻找一种随时间推移尖峰列车相似性的全局度量。信号如图所示(在这个例子中,我有 17 个神经元)。

图片

我可以使用窗口互相关吗?如果是,我应该如何处理输出矩阵?顺便说一句,我使用 MATLAB。

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python-3.x - python中眼动追踪数据分析(Eye-link)

我有来自眼球追踪的数据(.edf 文件 - 来自 SR-research 的 Eyelink)。我想对其进行分析并获得各种测量值,例如注视、扫视、持续时间等。是否有现有的软件包来分析眼动追踪数据?谢谢!

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neural-network - 如何在尖峰神经网络中将“布尔尖峰结果”映射到“浮点输入电流值”?

我的问题是关于尖峰神经网络。典型尖峰神经元的输入通常是一些浮点值,表示其流入电流,通常以 mA 或类似单位表示,如下面的简单示例:

这很好,如果它的目的是确定输入图像与某个类的关系,或者打开或关闭电机或灯。但这里出现了主要问题:模型不描述神经元互连。我们不能将一个神经元连接到下一个神经元,因为它通常发生在大脑内部。

如何将前一个神经元的转换bool isSpiked为下一个神经元float I输入值

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python - Deeplearning with electroencephalography (EEG) data

I am making a convolutional network model with which I want to classify EEG data. The data is an experiment where participants are evoked with images of 3 different classes with 2 subclasses each. To give a brief explanation about the dataset size, a subclass has ±300 epochs of a given participant (this applies for all the subclasses).

  1. Object
  2. Color
  3. Number

Now my question is: I have 5 participants in my training dataset, I took 15% of each participants' data and put it in the testing dataset. Can I consider the 15% as unseen data even though the same participant was used to train the model on?

Any input is welcome!

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python - 使用Nipy在python中下采样mri T1图像

我有一个 T1 图像 (NIFTI),已经对齐,尺寸为 121 x 145 x 121。
图像由 nibabel 加载。体素大小为 1.5 x 1.5 x 1.5 毫米。
我想将其下采样为分辨率为 2.0 x 2.0 x 2.0 mm 的图像并保持图像对齐。

我对MRI图像处理知之甚少。我找不到清晰的教程。

我怎么做 ?如果您知道任何其他 Python 库可以做到这一点,它也可以工作。

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matlab - Izhikevich 神经元模型 - 方程

在文献、论文和一本书(例如,[1] 和 [2])中,我发现了 Izhikevich 神经元模型的不同方程。

在 [1] 中,我发现了这个:

在 [2] 中,我发现了这个:

我试图从第二组方程转到第一组方程,忽略 C。我发现了这个:

然而,这给了我完全的垃圾。因此,我的问题如下:

为什么有两组不同的方程,如果我想模拟 Izhikevich 神经元,我应该采用哪一组?

额外问题 #1:我如何从第 2 组转到第 1 组?

额外问题 #2:我是否正确地说“我”在 [pA] 中?

参考:

[1] 脉冲神经元的简单模型 - EM Izhikevich (2003)

[2] 神经科学中的动力系统 - EM Izhikevich (2007)

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python - 在 python 中将 img/hdr 文件列表转换为 nifti1image

我有 img/hdr 文件的列表。假设列表长度为 50,img 大小为 60*60*60。我想将其转换为大小为 (60*60*60*50) 的 Nifti1image。

通过上面的程序,我得到了我想转换为 Nifti1image 的列表。然后我尝试

但我没有工作。有人可以告诉我如何在 python 中执行此操作吗?