问题标签 [neuroscience]
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neuroscience - jNeuroML 中的模拟完成/完成事件？
是否有一些事件机制可以让我知道模拟是否完成？
我有一个在 NEURON 中模拟的 LEMS 文件：
jnml LEMS_file.xml -neuron -run
模拟完成后，GUI 保持打开状态。
debugging - 调试 NEURON MOD 文件？
调试 NEURON 模拟器 .MOD 文件有哪些有用的方法？在其他语言中，通常可以使用 print() 语句来查看变量值。.MOD 文件中是否有类似 print() 语句的内容？
deep-learning - 当今深度学习和计算神经科学社区中的通用人工智能模型
我从 NIPS 跟踪了最近 DL 的进展。虽然我没有跟踪计算神经科学（CN）领域发生了什么。
但我想知道为什么关于通用人工智能（GAI）的工作如此之少？例如，用于构建所有监督/无监督/强化学习的各种 hebbian 网络。
或者谁能告诉我来自 CN 领域的 GAI 神经网络的最新技术？或者一些评论？
非常感谢！
machine-learning - 异端使用深度学习来寻找隐藏模式
感谢您对我在一项分析中应用的策略的评论/帮助。简而言之，我的情况是：
如果您能就我的逻辑的有效性向我提供任何意见，我将不胜感激。我想强调的是，我并不是试图根据行输入来预测刺激。
谢谢。
c++ - C++程序找不到boost
我正在尝试编译 MultiNEAT 项目（https://github.com/peter-ch/MultiNEAT）。我已经安装了 boost 和 boost-python，它位于 /usr/local/Cellar/boost。我还编辑了 ~/.bash_profile 以将 /usr/local/Cellar/boost/1.60.0_1/include 添加到 PATH。但是，当我尝试编译和安装 MultiNEAT 时
我得到了问题：
所以我的问题是：如何让程序找到 boost 库并成功编译 MultiNEAT？我的系统是 OS X Yosemite。谢谢！
neural-network - 在 NEURON .MOD 文件中，各部分的操作顺序是什么？
NEURON .MOD/NMODL 文件部分中的命令按什么顺序执行？具体来说，在这些块中：DERIVATIVE、BREAKPOINT 和 NET_RECEIVE。
neuroscience - jNeuroML 将 LEMS 命令放在生成的 NEURON .MOD/NMODL 的什么位置？
LEMS 中的以下标签如何映射到 NEURON .MOD/NMODL 文件中：
matlab - 在 MATLAB 中计算 PSTH（周刺激时间直方图）的矢量化方法
我有一个尖峰时间向量（来自神经元的动作电位）和一个刺激事件时间戳向量。我想创建一个 PSTH 来查看刺激是否会影响神经元的尖峰率。我可以通过循环遍历每个刺激事件来做到这一点（参见下面的简单示例），但是对于有超过 30,000 个刺激事件并且正在记录许多神经元的长时间实验来说，这非常慢。
如果没有 for 循环，如何做到这一点？
慢速方式示例：
matlab - 根据 N 个神经元网络的膜电位计算 Kuramoto 的 R
我在计算 N 个神经元网络的相干性（由 Kuramoto 阶参数 R 测量）时遇到问题。目前我从两个数组开始，一个“1x# 个数据点”数组保存每个数据点的时间，一个“Nx# 个数据点”数组保存每个数据点的 N 个神经元的膜电位。然后我计算每个神经元的尖峰时间和周期，并将这些数据存储在“Nx# of peaks”大小的矩阵中（其中第 i 行（i = 1 到 N）保存神经元 i 的尖峰时间或每个尖峰时间的周期神经元 i 分别）。此时我选择一个神经元作为参考神经元，计算每个其他神经元相对于参考神经元尖峰的相位，然后使用这些相位计算网络在参考神经元的每个尖峰时间的相干性（R）。这种计算 R 的方法似乎不是很稳健；在模拟开始时，当神经元没有很好地同步时，它们并不总是尖峰相同的次数，因此很难选择神经元 i 的尖峰时间（i=1 到 N-1，因为不包括参考神经元）与参考神经元的给定尖峰进行比较。
如果有人能够提出一种更好的方法来根据时间和膜电位数据以 Kuramoto 的 R 形式计算相干性，我会非常兴奋。如果这有助于说明一些事情，我可以发布我当前的代码。
非常感谢！
python - 艾伦脑研究所 - 大脑观测站示例
我正在尝试以大脑天文台 ipython notebook为例。
但是，我在加载nwb文件时遇到了问题，如下所示。
所以，我用HDFviewnwb打开了文件。
所有的大脑观测站nwb文件都没有打开，除了502376461.nwb.
它抛出了以下错误：
当我尝试502376461.nwb从艾伦打开 ipython 笔记本示例时，它起作用了！但是其他人（501940850，503820068...）像上面一样失败了。