我正在尝试在 for 循环中将多个文件导入到我的代码中以进行分析,但这些文件的格式并不完全相同(并且手动编辑的文件太多)。
我需要的数据在每个文件中都是相同的 - 我作为字符串导入的 13 列。下面是一个文件示例:
could not open XWindow display
could not open XWindow display
No graphics display available for this session.
Graphics tasks that attempt to plot to an interactive screen will fail.
/data/poohbah/2/asassn/be/F0041-70_2645
### JD HJD UT_date IMAGE FWHM Diff Limit mag mag_err counts counts_err flux(mJy) flux_err
2456784.50841 2456784.50816 2014-05-07.0072681 interp_bf002339_coadd 2.61 -2.65 17.031 15.543 0.093 526.82 44.57 2.328 0.197
2456789.45407 2456789.45347 2014-05-11.9529421 interp_be003585_coadd 2.26 -2.31 16.869 15.383 0.093 834.50 70.78 2.695 0.229
2456790.47441 2456790.47419 2014-05-12.9732922 interp_bf004070_coadd 1.72 -2.25 17.246 15.721 0.090 645.67 52.82 1.974 0.162
...
(data continues)
...
2457895.45745 2457895.45919 2017-05-21.9587133 interp_bf305499_coadd 1.71 -2.45 17.299 15.482 0.068 673.31 42.10 2.461 0.154
/data/poohbah/1/assassin/bin/./ap_phot_im_cal_test.py:654: RuntimeWarning: invalid value encountered in sqrt
counts_err_a = np.sqrt( counts_a / options.gain + (area_a * bg_stdev_a **2.0 ) )
/data/poohbah/1/assassin/bin/./ap_phot_im_cal_test.py:369: RuntimeWarning: invalid value encountered in less_equal
no_detected = np.nonzero( (counts <= limit) & (area >= 0.01) )[0]
/data/poohbah/1/assassin/bin/./ap_phot_im_cal_test.py:367: RuntimeWarning: divide by zero encountered in log10
maglimit[notbad] = -2.5 * np.log10(limit[notbad]) + def_zeropt
我只需要最后'###' 行和'/data' 路径之间的数据,并且在所有文件中,这部分的格式与13 列完全相同。但是,任何特定文件开头和结尾的“注释”可能会有所不同。有些没有“无法打开 XWindow 显示”,有些没有最后的路径。我尝试忽略以“#”或“/”开头的行,但这对于第一行或“counts_err_a”以及此特定示例末尾的此类行没有任何作用。
有没有办法将数据导入 Python 并且只获取其中包含特定列数的行?在伪代码中,它可能看起来像:
open(file_name)
if column_number = 13
np.genfromtxt(file_name)
else skip