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我有一个使用 构建的工作热图，gplots如下所示：

heatmap.2(as.matrix(matrix1),cellnote=as.matrix(matrix1),
    notecol="black",margins =c(9,6),trace="none",density.info="none",
    col=my_palette,Rowv=NA,Colv=NA,dendrogram="none",scale="row")

中的基础数据matrix1如下所示：

A       AA        AAA        BBB         CASH

CASH    0         0          0           0
JSUB    0.22171   0          0           2.20712
SECR    2.92828   1.97112    3.53786     0.91444
SENR    18.86672 11.53339   15.06844    21.57709
SSEN    5.707     1.96225    0.57815     2.93462
SSUB    0.36507   0.07968    0           0.44985
SUB     1.0539    0          0           2.37103
T1      0         0          0           0.56024
T2      1.87901   0          0           3.00718
UT2     0         0          0           0.15787

My matrix1，它被创建为cast使用包的函数的数据透视表reshape，包含许多零。每当我的矩阵中的值为零时，我不想显示“cellnote”，因为这只会混淆热图。

然而，到目前为止，我还没有弄清楚如何做到这一点，并感谢任何建议。

谢谢！

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1 回答 1

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对我来说，它只是制作一个用 NA 替换零的新矩阵，并将其作为参数传递给cellnote.

matrix2 <- as.matrix(matrix1)
matrix2[matrix2 == 0] <- NA

使用重新运行代码matrix2

heatmap.2(as.matrix(matrix1),cellnote=matrix2,
      notecol="black",margins =c(9,6),trace="none",density.info="none",
      col=my_palette,Rowv=NA,Colv=NA,dendrogram="none",scale="row")

给 在此处输入图像描述

（顺便说一句，你没有给出my_palette，所以我为这个例子散列了它。）

于 2017-01-18T14:24:00.167 回答