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我正在尝试使用包中的dredge功能MuMIn,如下所示。因为我想为不同的数据集运行它,所以我使用了一个函数,它接受协变量的向量,并且公式是从函数内的这个向量创建的。

require(lme4);require(MuMIn)
x1 <- rnorm(100)
x2 <- rnorm(100)
zrand <- sample(letters, 100, replace =T)
yind <- sample(1:1000, size=100, replace=T)
mydata <- data.frame(yind, x1, x2, zrand)
vars <- c('x1', 'x2')

当我以这种方式运行它时,我得到符号不是子集的错误。我认为这与vars在公式中使用有关,尽管 lmer 运行良好

myformula <- as.formula(paste('yind~',paste(vars,collapse='+'),'+(1|zrand)'))

mylmer1 <- lmer(myformula, mydata, gaussian)

dredge(mylmer1)

术语错误(as.formula(公式(x))):在为函数“术语”选择方法时评估参数“x”时出错:错误:“符号”类型的对象不可子集

但这很好用,原因我不完全理解,但与疏浚功能的范围有关。(我在这里可能完全不合时宜)

mylmer2 <- lmer(as.formula(paste('yind~',paste(vars,collapse='+'),'+(1|zrand)')), 
              mydata, gaussian)

dredge(mylmer2)

我在分析中所做的更类似于此,其中 lmer 和 dredge 在函数内运行

myfn <- function(fnd,fnvar){
  myformula <- as.formula(paste('yind~',paste(fnvar,collapse='+'),'+(1|zrand)'))
    print(myformula)

mylmer1 <- lmer(myformula, fnd, gaussian)
    print(mylmer1@call)
  print(dredge(mylmer1))

  mylmer2 <- lmer(as.formula(paste('yind~',paste(fnvar,collapse='+'),'+(1|zrand)')), 
                fnd, gaussian)

  print(mylmer2@call)
  print(dredge(mylmer2))
  }

myfn(fnd=mydata, fnvar=vars)

Dredgin 只有 lmer1 给出了这个错误:

Error in print(dredge(mylmer1)) : 
  error in evaluating the argument 'x' in selecting a method for function 'print': Error in terms(as.formula(formula(x))) : 
  error in evaluating the argument 'x' in selecting a method for function 'terms': Error: object of type 'symbol' is not subsettable

仅疏浚lmer2,出现以下错误

Error in print(dredge(mylmer2)) : 
  error in evaluating the argument 'x' in selecting a method for function 'print': Error in terms(as.formula(formula(x))) : 
  error in evaluating the argument 'x' in selecting a method for function 'terms': Error in paste(fnvar, collapse = "+") : object 'fnvar' not found.

有没有办法解决这个问题?这是疏浚功能的必要限制吗?

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我在这里找到了解决方案。显然它被称为“deparse-substitute技巧”。

mylmer1@call$formula <- tmp.formula

在疏浚mer物体之前

错过了它,因为我认为这与 MuMIn 有关。

于 2013-11-17T09:01:40.920 回答